RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 SH3BP5O60239 455 aa18.93■□□□□ 0.62
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CTIF-206ENST00000588345 TRIM16O95361 564 aa18.93■□□□□ 0.62
CTIF-206ENST00000588345 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
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CTIF-206ENST00000588345 CSKP41240 450 aa18.93■□□□□ 0.62
CTIF-206ENST00000588345 CDH18Q13634 790 aa18.93■□□□□ 0.62
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CTIF-206ENST00000588345 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
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CTIF-206ENST00000588345 PON1P27169 355 aa18.9■□□□□ 0.62
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CTIF-206ENST00000588345 ORAI3Q9BRQ5 295 aa18.9■□□□□ 0.62
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CTIF-206ENST00000588345 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa18.9■□□□□ 0.62
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CTIF-206ENST00000588345 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CTIF-206ENST00000588345 AKAP13Q12802 2813 aa18.89■□□□□ 0.61
CTIF-206ENST00000588345 A0A1B0GVT2 93 aa18.89■□□□□ 0.61
CTIF-206ENST00000588345 C10orf142B7Z368 130 aa18.89■□□□□ 0.61
CTIF-206ENST00000588345 F5H5T6 163 aa18.89■□□□□ 0.61
CTIF-206ENST00000588345 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
CTIF-206ENST00000588345 SLC2A3P11169 496 aa18.89■□□□□ 0.61
CTIF-206ENST00000588345 CD27P26842 260 aa18.89■□□□□ 0.61
CTIF-206ENST00000588345 USP8P40818 1118 aa18.89■□□□□ 0.61
CTIF-206ENST00000588345 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
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