RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 GUCY1A3Q02108 690 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 NFATC3Q12968 1075 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 CAPSQ13938 189 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 GRM2Q14416 872 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 SLC29A2Q14542 456 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ZNF699Q32M78 642 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 CENPUQ71F23 418 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ERICH1Q86X53 443 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 MAP7D3Q8IWC1 876 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 UBR7Q8N806 425 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 HAUS1Q96CS2 278 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 TBCBQ99426 244 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 C2CD2Q9Y426 696 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 TRPV2Q9Y5S1 764 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.37□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 TISP43B9A030 160 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 RNF8O76064 485 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 SCNN1AP37088 669 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 IL9RQ01113 521 aa8.36□□□□□ -1.07
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GGA3-218ENST00000584243 TFDP2Q14188 446 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 DSC3Q14574 896 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ZNF667Q5HYK9 610 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 TTC27Q6P3X3 843 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 RSPH3Q86UC2 560 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ZNF410Q86VK4 478 aa8.36□□□□□ -1.07
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GGA3-218ENST00000584243 MAGEC3Q8TD91 643 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ZNF606Q8WXB4 792 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 KAT5Q92993 513 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.36□□□□□ -1.07
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GGA3-218ENST00000584243 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 RSAD1Q9HA92 442 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 CYLDQ9NQC7 956 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 APCP25054 2843 aa8.36□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 MYH10P35580 1976 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ARNTLO00327 626 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 SUV39H1O43463 412 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 LIASO43766 372 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 CBFA2T3O75081 653 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 VNN1O95497 513 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 GLUD1P00367 558 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 KRT1P04264 644 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 GSTA2P09210 222 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 RALAP11233 206 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 SLC8A1P32418 973 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 SOX9P48436 509 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-218ENST00000584243 MYO1EQ12965 1108 aa8.35□□□□□ -1.07
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