RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.16■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1B0GVT2 93 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAF4O00268 1085 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GABBR2O75899 941 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV3-27P01718 113 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNTTP04053 509 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF18P17022 549 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RGS7P49802 495 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RING1Q06587 406 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCAPQ12770 1279 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEAD4Q15561 434 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MIIPQ5JXC2 388 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PMF1Q6P1K2 205 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PROSER1Q86XN7 944 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF366Q8N895 744 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNX19Q92543 992 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GOLGA1Q92805 767 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSFY1Q96LI6 401 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDC6Q99741 560 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FANCLQ9NW38 375 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LAMA5O15230 3695 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATRXP46100 2492 aa20.14■□□□□ 0.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FLRT2O43155 660 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MED7O43513 233 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACSL4O60488 711 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBL1XO60907 577 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEMA4FO95754 770 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SGSHP51688 502 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNJ12Q14500 433 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VWA3BQ502W6 1294 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SGK2Q9HBY8 427 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LHX6Q9UPM6 363 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KNL1Q8NG31 2342 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXO21O94952 628 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LTFP02788 710 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD27P26842 260 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD70P32970 193 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBX4P57082 545 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IQCB1Q15051 598 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF19Q2TAC6 998 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FIBINQ8TAL6 211 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTC17Q96AE7 1141 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BIRC7Q96CA5 298 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDST4Q9H3R1 872 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITPR1Q14643 2758 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 M0QYV0 167 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIK3R2O00459 728 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC6A4P31645 630 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRIA4P48058 902 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LMLNQ96KR4 655 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STIM2Q9P246 746 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCML1Q9UN30 329 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNX11Q9Y5W9 270 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FSBPO95073 299 aa20.11■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASLP04424 464 aa20.11■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP8P40818 1118 aa20.11■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF165P49910 485 aa20.11■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ST8SIA6P61647 398 aa20.11■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP30Q70CQ3 517 aa20.11■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.11■□□□□ 0.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MFN1Q8IWA4 741 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms