RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	SEMA7A	O75326	666 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	AKAP3	O75969	853 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	OAZ2	O95190	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ESR1	P03372	595 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	P4HA1	P13674	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GJA1	P17302	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CD58	P19256	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PAX3	P23760	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CCNE1	P24864	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LMO2	P25791	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ITPKB	P27987	946 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PPP1R2	P41236	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ABCG1	P45844	678 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MAPK8	P45983	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CCR10	P46092	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SERPINB4	P48594	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LHX1	P48742	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	AP3M2	P53677	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ROR1	Q01973	937 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TNK2	Q07912	1038 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TWF1	Q12792	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MORC3	Q14149	939 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SSPN	Q14714	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	IKBKB	O14920	756 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	DCLK1	O15075	740 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC28A2	O43868	658 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ABLIM3	O94929	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CAVIN2	O95810	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	EFEMP2	O95967	443 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ATF2	P15336	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TYMP	P19971	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	BDNF	P23560	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CYP2F1	P24903	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LAMA1	P25391	3075 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ANXA13	P27216	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PCSK1	P29120	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ATIC	P31939	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	USP8	P40818	1118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CETN1	Q12798	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PAK1	Q13153	545 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR17	Q13304	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	NKG7	Q16617	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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