RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	OVGP1	Q12889	678 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	MPPE1	Q53F39	396 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	IFI44	Q8TCB0	444 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	CGRRF1	Q99675	332 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	OMD	Q99983	421 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	GJB6	O95452	261 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	THEGL	P0DJG4	465 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	GOT1	P17174	413 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	GAP43	P17677	238 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TNNI1	P19237	187 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	ADORA2B	P29275	332 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	ATIC	P31939	592 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	PSEN1	P49768	467 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	METAP1	P53582	386 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	INHBC	P55103	352 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	PSMD6	Q15008	389 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	RDH13	Q8NBN7	331 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	ABCG4	Q9H172	646 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298		K7ESM1	405 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	ITGA2B	P08514	1039 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	RALA	P11233	206 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	NDST1	P52848	882 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	CYP24A1	Q07973	514 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	ARL14	Q8N4G2	192 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	ARRDC3	Q96B67	414 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TWNK	Q96RR1	684 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	CREBBP	Q92793	2442 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TTC34	A8MYJ7	566 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	SCAMP1	O15126	338 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	MAGEC1	O60732	1142 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	NEBL	O76041	1014 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	SLC5A2	P31639	672 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	PSMD8	P48556	350 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	CYP4F2	P78329	520 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	TRPC3	Q13507	836 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	ALCAM	Q13740	583 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	STAT4	Q14765	748 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CS-208	ENST00000547298	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53

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