RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533259.1

PDE4DIP-231, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 4

Gene PDE4DIP, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PIK3R2	O00459	728 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	OPHN1	O60890	802 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CAPNS1	P04632	268 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MAOB	P27338	520 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PSEN1	P49768	467 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RGS7	P49802	495 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BCAT1	P54687	386 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FMO1	Q01740	532 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PIGZ	Q86VD9	579 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LHX5	Q9H2C1	402 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KLK13	Q9UKR3	277 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TULP2	O00295	520 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HMBS	P08397	361 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SETSIP	P0DME0	302 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RALA	P11233	206 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LCP1	P13796	627 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	IL12RB1	P42701	662 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GPD2	P43304	727 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	COG7	P83436	770 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FUT11	Q495W5	492 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RAB41	Q5JT25	222 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NAA35	Q5VZE5	725 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMEM215	Q68D42	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ERICH1	Q86X53	443 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KNTC1	P50748	2209 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TAF4	O00268	1085 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NRDC	O43847	1150 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SH3BP5	O60239	455 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NDUFS2	O75306	463 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SYP	P08247	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CD6	P30203	668 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CHKA	P35790	457 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SNX16	P57768	344 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CDK17	Q00537	523 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC14A1	Q13336	389 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MEA1	Q16626	185 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PKDCC	Q504Y2	493 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CPXM2	Q8N436	756 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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