RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 ALOX5P09917 674 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ITGA8P53708 1063 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CNTN2Q02246 1040 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PDK1Q15118 436 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ZBED5Q49AG3 693 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SGO2Q562F6 1265 aa8.69□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 FAM213AQ9BRX8 229 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.69□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 ETFBP38117 255 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 MFAP3P55082 362 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CYP24A1Q07973 514 aa8.68□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 PTK6Q13882 451 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 DGKDQ16760 1214 aa8.68□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 POMPQ9Y244 141 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 NFASCO94856 1347 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1W2PPM1 405 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SYCE1LA8MT33 242 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CYP11B1P15538 503 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 MARCKSL1P49006 195 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 TPTEP56180 551 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PPP2R2BQ00005 443 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 EMC2Q15006 297 aa8.68□□□□□ -1.02
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