RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ENGP17813 658 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TGM2P21980 687 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 NDUFS1P28331 727 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 MCM7P33993 719 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 GJC1P36383 396 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 DCAF7P61962 342 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 DMWDQ09019 674 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 FOXI1Q12951 378 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PDCLQ13371 301 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCDC105Q8IYK2 499 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TNIP2Q8NFZ5 429 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CAGE1Q8TC20 777 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF398Q8TD17 642 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 NCSTNQ92542 709 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ATP2A3Q93084 1043 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CAVIN3Q969G5 261 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 APOPT1Q96IL0 206 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CIPCQ9C0C6 399 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 USP29Q9HBJ7 922 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 IRAK4Q9NWZ3 460 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 MYRFQ9Y2G1 1151 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 AGAP5A6NIR3 686 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 NPIPB13A6NJU9 1138 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TEX22C9J3V5 150 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRYO14603 147 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TSPAN4O14817 238 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 USO1O60763 962 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TBX18O95935 607 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SCGB1D1O95968 90 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADH4P08319 380 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADRB1P08588 477 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ATP1A3P13637 1013 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARSAP15289 507 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRPH2P23942 346 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 AGTR2P50052 363 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CACNA2D1P54289 1103 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 DGCR2P98153 550 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SEC23BQ15437 767 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM153CQ494X1 144 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 LRRC24Q50LG9 513 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF766Q5HY98 468 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 CFAP161Q6P656 301 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 GJB7Q6PEY0 223 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMTC3Q6ZXV5 915 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 GALNT4Q8N4A0 578 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC44A3Q8N4M1 653 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 LINS1Q8NG48 757 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 BCAS4Q8TDM0 211 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZUFSPQ96AP4 578 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 C5orf34Q96MH7 638 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACAD9Q9H845 621 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 MMRN2Q9H8L6 949 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 THAP1Q9NVV9 213 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ASIC5Q9NY37 505 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 TAS2R10Q9NYW0 307 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 FBXO40Q9UH90 709 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 HSF4Q9ULV5 492 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 DTX4Q9Y2E6 619 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-390P-201ENST00000516259 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms