RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 PMS2P11Q13670 270 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 DHCR24Q15392 516 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC25A30Q5SVS4 291 aa0.57□□□□□ -2.32
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RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM64Q6YI46 380 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 Q6ZSV7 163 aa0.57□□□□□ -2.32
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RNU6-162P-201ENST00000516228 GPSM1Q86YR5 675 aa0.57□□□□□ -2.32
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RNU6-162P-201ENST00000516228 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
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RNU6-162P-201ENST00000516228 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
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RNU6-162P-201ENST00000516228 MYBPHQ13203 477 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 DNASE1L3Q13609 305 aa0.56□□□□□ -2.32
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RNU6-162P-201ENST00000516228 NHLRC1Q6VVB1 395 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 NEK10Q6ZWH5 1172 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP0.56□□□□□ -2.32
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RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 TTC1Q99614 292 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 VGLL1Q99990 258 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 ASNSD1Q9NWL6 643 aa0.56□□□□□ -2.32
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RNU6-162P-201ENST00000516228 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
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RNU6-162P-201ENST00000516228 ALG10BQ5I7T1 473 aa0.55□□□□□ -2.32
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RNU6-162P-201ENST00000516228 NINJ1Q92982 152 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF653Q96CK0 615 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 KLHL29Q96CT2 875 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 MOCOSQ96EN8 888 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 CABLES2Q9BTV7 478 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANAPC11Q9NYG5 84 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 A6NNZ2 444 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 MARK3P27448 753 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 GATMP50440 423 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 DGKQP52824 942 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-162P-201ENST00000516228 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
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