RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513346.5

TCOF1-211, Transcript of treacle ribosome biogenesis factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TCOF1, Length 4,646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1-211ENST00000513346 A0A0B4J269 797 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 DFFAO00273 331 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 STK25O00506 426 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 LRRC38Q5VT99 294 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 C7orf26Q96N11 449 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 COG4Q9H9E3 785 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 STK39Q9UEW8 545 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 COG5Q9UP83 839 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 COQ6Q9Y2Z9 468 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 TRIM38O00635 465 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 ITGB3P05106 788 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 NAMPTP43490 491 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 KRT33BQ14525 404 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 HPS6Q86YV9 775 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 SOCS4Q8WXH5 440 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 MECRQ9BV79 373 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 CDH22Q9UJ99 828 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 GMEB1Q9Y692 573 aa11.49□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 MYO1GB0I1T2 1018 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 EML1O00423 815 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 CAPN15O75808 1086 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 APOC2P02655 101 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 THPOP40225 353 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 RBBP7Q16576 425 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 FUT11Q495W5 492 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 GALNTL6Q49A17 601 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 PRMT9Q6P2P2 845 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 TAS2R42Q7RTR8 314 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 CDC26Q8NHZ8 85 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 ZNF606Q8WXB4 792 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 MBOAT7Q96N66 472 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 VPS45Q9NRW7 570 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 ACOT9Q9Y305 439 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 NID2Q14112 1375 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 PENKP01210 267 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 TAF6P49848 677 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 MPP3Q13368 585 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 ZNF846Q147U1 533 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 RGMBQ6NW40 437 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 SHC3Q92529 594 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 RORBQ92753 470 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 TUBGCP3Q96CW5 907 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 TRIM17Q9Y577 477 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 AKAP12Q02952 1782 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 NR5A2O00482 541 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 INPP4BO15327 924 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 DDHD2O94830 711 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 SUPT7LO94864 414 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 SLITRK3O94933 977 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 RAD23AP54725 363 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 NFYCQ13952 458 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 TAF5Q15542 800 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 BMT2Q1RMZ1 405 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 GRTP1Q5TC63 336 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 MOB2Q70IA6 237 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 SFRP1Q8N474 314 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 ULK4Q96C45 1275 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 RTKNQ9BST9 563 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 KLK14Q9P0G3 267 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 VWA5AO00534 786 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 MED26O95402 600 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 PSMB9P28065 219 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 SOX6P35712 828 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 HADHAP40939 763 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 SLC26A2P50443 739 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 RPL14P50914 215 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 NEK3P51956 506 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 DLG4P78352 724 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 CYP1B1Q16678 543 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 KIZQ2M2Z5 673 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 CRY2Q49AN0 593 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 AGAP9Q5VTM2 703 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 METTL7BQ6UX53 244 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 OTOP1Q7RTM1 612 aa11.48□□□□□ -0.57
TCOF1-211ENST00000513346 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms