RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H0Y626 953 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TPM2P07951 284 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HLA-EP13747 358 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCNN1AP37088 669 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GABRB2P47870 512 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC12A1Q13621 1099 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDH18Q13634 790 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARID5BQ14865 1188 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAP1GAP2Q684P5 730 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SASS6Q6UVJ0 657 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHSY1Q86X52 802 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFAP52Q8N1V2 620 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF34Q969K3 372 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM204AQ9H8W3 233 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAPN10Q9HC96 672 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRSS16Q9NQE7 514 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDIT4Q9NX09 232 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUSD2Q9UGT4 822 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 F5H5T6 163 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DAB1O75553 588 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRAP2O75791 330 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNK5O95279 499 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MOCS3O95396 460 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ENGP17813 658 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSKP41240 450 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MATKP42679 507 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ST8SIA6P61647 398 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FSCBQ5H9T9 825 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNASE2BQ8WZ79 361 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C18orf8Q96DM3 657 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYO19Q96H55 970 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCED1AQ9H1Q7 454 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANO10Q9NW15 660 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FANCLQ9NW38 375 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAB2Q9NYJ8 693 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 METTL12A8MUP2 240 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 F8VZ95 297 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LSM8O95777 96 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFIP05156 583 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNSP15586 552 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OXCT1P55809 520 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT31Q15323 416 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PITRM1Q5JRX3 1037 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RABGAP1LQ5R372 815 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FKBP15Q5T1M5 1219 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERICH1Q86X53 443 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF677Q86XU0 584 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGL4Q8IZJ4 473 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NT5C3BQ969T7 300 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R9BQ96SB3 815 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPY6RQ99463 290 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR174Q9BXC1 333 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VPS16Q9H269 839 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC10BA6NIK2 292 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 M0QYT0 321 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MBD3O95983 291 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 F9P00740 461 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYPP08247 313 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLK1P53350 603 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ECT2LQ008S8 904 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NME3Q13232 169 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKHG6Q3KR16 790 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBXL22Q6P050 247 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF366Q8N895 744 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRGPRX3Q96LB0 322 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GANQ9H2C0 597 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STAP1Q9ULZ2 295 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCML1Q9UN30 329 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERVW-1Q9UQF0 538 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1B0GVM2 712 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCAF2A6NFQ2 919 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UPK3BL1B0FP48 263 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UPK3BL2E5RIL1 263 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGAP33O14559 1287 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNTTP04053 509 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEACAM1P13688 526 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CXCR3P49682 368 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPS14P62263 151 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SULT2A1Q06520 285 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AUHQ13825 339 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STX1AQ16623 288 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C5orf22Q49AR2 442 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms