RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497425.1

TTC21B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, human

TSL 3

Gene TTC21B, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21B-208	ENST00000497425	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	GRM8	O00222	908 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	IKBKB	O14920	756 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	GCAT	O75600	419 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	CYP2D6	P10635	497 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ACP5	P13686	325 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	CYP3A7	P24462	503 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ELF1	P32519	619 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	DDIT3	P35638	169 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	STAT6	P42226	847 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	LIFR	P42702	1097 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	VPS41	P49754	854 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	VAMP2	P63027	116 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	CDK18	Q07002	472 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	KCNB1	Q14721	858 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	CLPB	Q9H078	707 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	PEX12	O00623	359 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	PRY	O14603	147 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ANP32C	O43423	234 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	TSPAN3	O60637	253 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	MBD4	O95243	580 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	LYL1	P12980	280 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	NDUFS1	P28331	727 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	PGM1	P36871	562 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	PNPLA4	P41247	253 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	NR1H2	P55055	460 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC37A1	P57057	533 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SHC2	P98077	582 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	MPP1	Q00013	466 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	GPR78	Q96P69	363 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425		H3BNC9	293 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	JTB	O76095	146 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	CD4	P01730	458 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	HOXD12	P35452	270 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	KRT9	P35527	623 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TTC21B-208	ENST00000497425	GPR162	Q16538	588 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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