RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484454.1

TARBP1-208, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene TARBP1, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP1-208	ENST00000484454	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	HTRA1	Q92743	480 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PEX12	O00623	359 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	RRH	O14718	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CNTN5	O94779	1100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PRPH2	P23942	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	AVPR2	P30518	371 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PNPLA4	P41247	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	LIFR	P42702	1097 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	MAPK7	Q13164	816 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	NPAS1	Q99742	590 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	MAF1	Q9H063	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARBP1-208	ENST00000484454	AOX1	Q06278	1338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454		A6NLC8	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454		J3KRW8	73 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	CYR61	O00622	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	XBP1	P17861	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TFF2	Q03403	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	DSCR3	O14972	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SYN3	O14994	580 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ANP32C	O43423	234 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ARSA	P15289	507 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TGFB2	P61812	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	YPEL5	P62699	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TDG	Q13569	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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