RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB42Q8N4Z0 105 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACTR8Q9H981 624 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPBGLP0DKB5 382 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC45A4Q5BKX6 768 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADCK1Q86TW2 530 aa16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIGNO95427 931 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PGK1P00558 417 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGALP20701 1170 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKNOX1P55347 436 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHRNB3Q05901 458 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF410Q86VK4 478 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLD3Q8IV08 490 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BSNDQ8WZ55 320 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B3GNT5Q9BYG0 378 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLIN4Q96Q06 1357 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP16.93■□□□□ 0.33e-6■□□□□ 8.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEX5P50542 639 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MARSP56192 900 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALLCQ8N6M5 410 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAMKK2Q96RR4 588 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBXN6Q9BZV1 441 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APPL1Q9UKG1 709 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASZ1Q86V15 1759 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGEB16A2A368 324 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOT1P17174 413 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMC3P17980 439 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCYT1AP49585 367 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRIM2P49643 509 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BBS12Q6ZW61 710 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDRT15Q96T59 188 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH3GL3Q99963 347 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TINF2Q9BSI4 451 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM50BQ9Y247 325 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BTNL10A8MVZ5 291 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXO6A8MYZ6 492 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPP1O14773 563 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OPLAHO14841 1288 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAN1A2O60476 641 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZMPSTE24O75844 475 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CST3P01034 146 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOS2P35228 1153 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCKAP1LP55160 1127 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMC7Q7Z402 723 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ART4Q93070 314 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDHR5Q9HBB8 845 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C5P01031 1676 aa16.93■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PPM1 405 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLCO1B7G3V0H7 640 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP6V1B2P21281 511 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLDN5O00501 218 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC38Q5VT99 294 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JADE3Q92613 823 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MID1IP1Q9NPA3 183 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NR2E1Q9Y466 385 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0A0MRY4 1105 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AKR1A1P14550 325 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK16Q00536 496 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BST1Q10588 318 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRTP1Q5TC63 336 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LPPQ93052 612 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA13Q96N96 652 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms