RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 ALG6Q9Y672 507 aa6.52□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 LEFTY2O00292 366 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SPOPO43791 374 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 AP1G2O75843 785 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 FGGP02679 453 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 IRF1P10914 325 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 KRT5P13647 590 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CHRNB2P17787 502 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ADORA2BP29275 332 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 WEE1P30291 646 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ATICP31939 592 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GJA4P35212 333 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GALK1P51570 392 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CCR3P51677 355 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SEC13P55735 322 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 RWDD2BP57060 319 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 TAF10Q12962 218 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 EML3Q32P44 896 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 VSTM1Q6UX27 236 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 FAM35AQ86V20 835 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 C12orf29Q8N999 325 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SPATA18Q8TC71 538 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 IFT81Q8WYA0 676 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SPATA17Q96L03 361 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MYRFLQ96LU7 910 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 NUP85Q9BW27 656 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ECT2Q9H8V3 914 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 NFU1Q9UMS0 254 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SCINQ9Y6U3 715 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CACNA1AO00555 2505 aa6.51□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 K7ESF4 209 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 AGPSO00116 658 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 LILRB5O75023 590 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PHF2O75151 1096 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 BEST1O76090 585 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MMEP08473 750 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CD58P19256 250 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ACTN2P35609 894 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CETN2P41208 172 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ID4P47928 161 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 LMAN1P49257 510 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 FNTAP49354 379 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 PGFP49763 221 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 NDST1P52848 882 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MAP3K7CLP57077 242 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CENPCQ03188 943 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 USP4Q13107 963 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CUL2Q13617 745 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CCINQ13939 588 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 NR6A1Q15406 480 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CCDC6Q16204 474 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CPA6Q8N4T0 437 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 NELL1Q92832 810 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 KAT5Q92993 513 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 FBXO32Q969P5 355 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 WBP2Q969T9 261 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 RMDN1Q96DB5 314 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 C8orf48Q96LL4 319 aa6.5□□□□□ -1.37
MITF-215ENST00000478490 HHIPQ96QV1 700 aa6.5□□□□□ -1.37
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