RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	SPEG	Q15772	3267 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	IGF2R	P11717	2491 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	NDUFS2	O75306	463 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	DAB1	O75553	588 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	SYP	P08247	313 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF883	P0CG24	379 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	TACR2	P21452	398 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	CDK17	Q00537	523 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	NUMA1	Q14980	2115 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	TAF5	Q15542	800 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	USP30	Q70CQ3	517 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	ARC	Q7LC44	396 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	BNIPL	Q7Z465	357 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307	CHD6	Q8TD26	2715 aa		12.77	□□□□□ -0.36
PGAP2-215	ENST00000469307		A0A1B0GTW7	788 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	CAPN9	O14815	690 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	ACADM	P11310	421 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	HLA-E	P13747	358 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	GNS	P15586	552 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	CCR1	P32246	355 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	NOS2	P35228	1153 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	CSK	P41240	450 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	OXCT1	P55809	520 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC6A3	Q01959	620 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	ARID5A	Q03989	594 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	FSCB	Q5H9T9	825 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	ARTN	Q5T4W7	220 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	ADAM32	Q8TC27	787 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	ALG14	Q96F25	216 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	SGK2	Q9HBY8	427 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307		A0A1B0GVM2	712 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	GIPC1	O14908	333 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	ERBB2	P04626	1255 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	CD59	P13987	128 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	UCHL3	P15374	230 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	CYP11B1	P15538	503 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	KRT9	P35527	623 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	MATK	P42679	507 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	SULT2A1	Q06520	285 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	CDH18	Q13634	790 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF677	Q86XU0	584 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	DEFB106A	Q8N104	65 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	NPY6R	Q99463	290 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	GPR174	Q9BXC1	333 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	STK33	Q9BYT3	514 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	AKAP13	Q12802	2813 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PGAP2-215	ENST00000469307	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		12.75	□□□□□ -0.37

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