RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467065.1

UBXN4-205, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN4, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-205ENST00000467065 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.86□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 SLC12A8A0AV02 714 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 M0QYT0 321 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 SMAPO00193 183 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 TULP2O00295 520 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 TRIM24O15164 1050 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 AXIN1O15169 862 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 KAT7O95251 611 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 APBB3O95704 486 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 CALCAP01258 141 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 APODP05090 189 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 RETP07949 1114 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 HMBSP08397 361 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 KRT7P08729 469 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 CHRNB2P17787 502 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 TGM1P22735 817 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 RRM1P23921 792 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 HOXA6P31267 233 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 CNR2P34972 360 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 CHKAP35790 457 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 MATKP42679 507 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 GABRB2P47870 512 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 SULT1E1P49888 294 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 VAV2P52735 878 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 DAOAP59103 153 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 GAD2Q05329 585 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 EFEMP1Q12805 493 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 MESDQ14696 234 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 E2F5Q15329 346 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 CCDC6Q16204 474 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 ANO4Q32M45 955 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 BOLA3Q53S33 107 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 CCDC181Q5TID7 509 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 EMC10Q5UCC4 262 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 ANO7Q6IWH7 933 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 WDR59Q6PJI9 974 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 BEND5Q7L4P6 421 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 SYT13Q7L8C5 426 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 SCD5Q86SK9 330 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 KBTBD6Q86V97 674 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 TMEM25Q86YD3 366 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 MIB1Q86YT6 1006 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 SCML4Q8N228 414 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 ALLCQ8N6M5 410 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 RFFLQ8WZ73 363 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 EDEM1Q92611 657 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 BHMTQ93088 406 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 MCEEQ96PE7 176 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 CPXM1Q96SM3 734 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 PNKPQ96T60 521 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 CNPY3Q9BT09 278 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 THAP2Q9H0W7 228 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 DDIT4Q9NX09 232 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 INVSQ9Y283 1065 aa6.85□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 DCLK1O15075 740 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 MAP3K7O43318 606 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 TULP3O75386 442 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 GRAP2O75791 330 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 STC2O76061 302 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 ERBB2P04626 1255 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-205ENST00000467065 TNNT1P13805 278 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.8 ms