RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1-208ENST00000466278 EPS8L1Q8TE68 723 aa23.59■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 FOXJ1Q92949 421 aa23.59■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ITM2CQ9NQX7 267 aa23.59■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 TMEM74BQ9NUR3 256 aa23.59■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 RRN3Q9NYV6 651 aa23.59■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 H0Y626 953 aa23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 OXTRP30559 389 aa23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 SCNN1AP37088 669 aa23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CSKP41240 450 aa23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 IRX4P78413 519 aa23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CACUL1Q86Y37 369 aa23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 ZNF366Q8N895 744 aa23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 CEP76Q8TAP6 659 aa23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 TTC17Q96AE7 1141 aa23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 TMEM9BQ9NQ34 198 aa23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 STAP1Q9ULZ2 295 aa23.58■■□□□ 1.37
MKL1-208ENST00000466278 TM4SF5O14894 197 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 MOCS3O95396 460 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 IGLV3-19P01714 112 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 MATKP42679 507 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 GABRB2P47870 512 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 TPMTP51580 245 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 ST8SIA6P61647 398 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 NME3Q13232 169 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 RABGAP1LQ5R372 815 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SLC23A3Q6PIS1 610 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 ERICH1Q86X53 443 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 ZNF677Q86XU0 584 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 C18orf8Q96DM3 657 aa23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 A0A1B0GVM2 712 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 TCAF2A6NFQ2 919 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 C4orf47A7E2U8 309 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 M0QYT0 321 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 CFIP05156 583 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 KLK7P49862 253 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 DUOXA1Q1HG43 343 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 FSCBQ5H9T9 825 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 PITRM1Q5JRX3 1037 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SYCP2LQ5T4T6 812 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 KDM1BQ8NB78 822 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SUN2Q9UH99 717 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.56■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 LGALS16A8MUM7 142 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 GFPT2O94808 682 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 MMEP08473 750 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 C7P10643 843 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SOX5P35711 763 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 JAM2P57087 298 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 NOMO3P69849 1222 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 WDR45BQ5MNZ6 344 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 XYLT1Q86Y38 959 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SPAG5Q96R06 1193 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 NPY6RQ99463 290 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 GPR174Q9BXC1 333 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 PRSS16Q9NQE7 514 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SUSD2Q9UGT4 822 aa23.55■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 MEI4A8MW99 385 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SERPINF2P08697 491 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 KCNA4P22459 653 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SULT1E1P49888 294 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 ZBTB16Q05516 673 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 TYRO3Q06418 890 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SLC12A1Q13621 1099 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SYCP1Q15431 976 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 PLEKHG6Q3KR16 790 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 FBXL22Q6P050 247 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 RGL4Q8IZJ4 473 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 CADM4Q8NFZ8 388 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 MYO19Q96H55 970 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 NUP58Q9BVL2 599 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 TMEM51Q9NW97 253 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SLC6A14Q9UN76 642 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.54■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 EPHB6O15197 1021 aa23.53■■□□□ 1.36
MKL1-208ENST00000466278 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms