RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437840.6

RGL2-238, Transcript of ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 2, human

TSL 1 (best)

Gene RGL2, Length 2,687 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGL2-238	ENST00000437840	PTPRF	P10586	1907 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	OPHN1	O60890	802 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PGK2	P07205	417 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	VCL	P18206	1134 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TYK2	P29597	1187 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RANBP1	P43487	201 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	NUMB	P49757	651 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	DLG1	Q12959	904 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	USP4	Q13107	963 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PEX6	Q13608	980 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	EPGN	Q6UW88	154 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PPEF2	O14830	753 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MFSD11	O43934	449 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	KRT34	O76011	436 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CPA3	P15088	417 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SCNN1A	P37088	669 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GP5	P40197	560 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GRIA2	P42262	883 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SNX16	P57768	344 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CCDC153	Q494R4	210 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	KIF12	Q96FN5	646 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	HAPLN3	Q96S86	360 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	EPAS1	Q99814	870 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CENPK	Q9BS16	269 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	COG4	Q9H9E3	785 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TRIP11	Q15643	1979 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RNF103	O00237	685 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	DCX	O43602	365 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PEX1	O43933	1283 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ERVK-10	P10266	1014 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	COX4I1	P13073	169 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	INSRR	P14616	1297 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RAG1	P15918	1043 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MX2	P20592	715 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	IGBP1	P78318	339 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CFAP157	Q5JU67	520 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RASIP1	Q5U651	963 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	P2RY11	Q96G91	374 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SNX15	Q9NRS6	342 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CNMD	O75829	334 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MLH1	P40692	756 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GLUD2	P49448	558 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CUL3	Q13618	768 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GRTP1	Q5TC63	336 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	C7orf31	Q8N865	590 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CERS2	Q96G23	380 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CPNE1	Q99829	537 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CDH19	Q9H159	772 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
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RGL2-238	ENST00000437840	SCN1A	P35498	2009 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840		G3V2L1	256 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	TSPAN1	O60635	241 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	ZMPSTE24	O75844	475 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	CCDC130	P13994	396 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	PSMB4	P28070	264 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	KLF10	Q13118	480 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	CES3	Q6UWW8	571 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	STRADA	Q7RTN6	431 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	TNS4	Q8IZW8	715 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	DCLK2	Q8N568	766 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	BTBD9	Q96Q07	612 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	RTKN	Q9BST9	563 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	CEP41	Q9BYV8	373 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	FZD10	Q9ULW2	581 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGL2-238	ENST00000437840	FZD9	O00144	591 aa		15.14	■□□□□ 0.01

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