RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 DACH1Q9UI36 760 aa15.7■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CEP83Q9Y592 693 aa15.7■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa15.7■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 F5H5T6 163 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CER1O95813 267 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CD59P13987 128 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PON1P27169 355 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 KRT9P35527 623 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 NNMTP40261 264 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CSKP41240 450 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 RPS14P62263 151 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CFAP52Q8N1V2 620 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 OR2I1PQ8NGU4 316 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 GANCQ8TET4 914 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 RNF34Q969K3 372 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PPP1R9BQ96SB3 815 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 FAM204AQ9H8W3 233 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ACP6Q9NPH0 428 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ASNSD1Q9NWL6 643 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CYTH4Q9UIA0 394 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PCDHGC3Q9UN70 934 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CEP295Q9C0D2 2601 aa15.69■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CKAP5Q14008 2032 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 BECN2A8MW95 431 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 KCNU1A8MYU2 1149 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 HSF2BPO75031 334 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SEMA4FO95754 770 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PROS1P07225 676 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 TACR2P21452 398 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CCR1P32246 355 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ACSL1P33121 698 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 MATKP42679 507 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 OXCT1P55809 520 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 BPIFB4P59827 614 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SLC12A1Q13621 1099 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 TEAD4Q15561 434 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 MAN2A1Q16706 1144 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 RABGAP1LQ5R372 815 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 LRSAM1Q6UWE0 723 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 USP30Q70CQ3 517 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 IRF2BP1Q8IU81 584 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 LMLNQ96KR4 655 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SCNM1Q9BWG6 230 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ADAM33Q9BZ11 813 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SYNCQ9H7C4 482 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 DDIT4Q9NX09 232 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 DNAJC12Q9UKB3 198 aa15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 GJB3O75712 270 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 IGLV3-25P01717 112 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ZNF883P0CG24 379 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ECT2LQ008S8 904 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SULT2A1Q06520 285 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ARID5BQ14865 1188 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 NAXDQ8IW45 347 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 DEFB106AQ8N104 65 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CPXM1Q96SM3 734 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PDCL3Q9H2J4 239 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CLSTN2Q9H4D0 955 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 GAREM1Q9H706 876 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 OSGEPQ9NPF4 335 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 WASF3Q9UPY6 502 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ERVW-1Q9UQF0 538 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.67■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 A0A1B0GVM2 712 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 TCAF2A6NFQ2 919 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SH3BP5O60239 455 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SIN3BO75182 1162 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 KRT37O76014 449 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 FSBPO95073 299 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 TAF5Q15542 800 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 FSCBQ5H9T9 825 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PASD1Q8IV76 773 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 WDTC1Q8N5D0 677 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 MYEOVQ96EZ4 313 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 MYO19Q96H55 970 aa15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms