RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PANK2Q9BZ23 570 aa17.21■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM4Q9C037 500 aa17.21■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCG4Q9H172 646 aa17.21■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTG2Q9H4K7 406 aa17.21■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EVA1BQ9NVM1 165 aa17.21■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DMTF1Q9Y222 760 aa17.21■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D3EA0A087X179 549 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D3LB9A6J9 549 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SDC3O75056 442 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADH1BP00325 375 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D3HP0C7X1 549 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CKMT1AP12532 417 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C5AR1P21730 350 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASPAP45381 313 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EHHADHQ08426 723 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STAT4Q14765 748 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KMT5BQ4FZB7 885 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NELFCDQ8IXH7 590 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTC17Q96AE7 1141 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYO19Q96H55 970 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBXN6Q9BZV1 441 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDM4CQ9H3R0 1056 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLIC4Q9Y696 253 aa17.2■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASS1P00966 412 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALPPL2P10696 532 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD70P32970 193 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SKOR1P84550 965 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMPD3Q01432 767 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZACNQ401N2 412 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9orf64Q5T6V5 341 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A45Q8N413 288 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHO2Q8TD55 490 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC46A1Q96NT5 459 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TWNKQ96RR1 684 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP3A43Q9HB55 503 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP29Q9HBJ7 922 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL12A1Q99715 3063 aa17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A087X0B3 334 aa17.18■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GVM2 712 aa17.18■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT10P13645 584 aa17.18■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DGKAP23743 735 aa17.18■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AADATQ8N5Z0 425 aa17.18■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GOLGA5Q8TBA6 731 aa17.18■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IMPG2Q9BZV3 1241 aa17.18■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TJP2Q9UDY2 1190 aa17.18■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMC3Q9UQE7 1217 aa17.18■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IRAK2O43187 625 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMD8P48556 350 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC8A3P57103 927 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP2CBP62714 309 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP2CAP67775 309 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ISXQ2M1V0 245 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARL13BQ3SXY8 428 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C3orf38Q5JPI3 329 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB41Q5JT25 222 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMC6Q7Z403 805 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MFN1Q8IWA4 741 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDILTQ8N807 584 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXD3Q8N9H8 876 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FIBINQ8TAL6 211 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WFDC5Q8TCV5 224 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF139Q8WU17 664 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CUEDC2Q9H467 287 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KBTBD4Q9NVX7 518 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYTH4Q9UIA0 394 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SATB2Q9UPW6 733 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa17.17■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa17.16■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBL1XO60907 577 aa17.16■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBED1O96006 694 aa17.16■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SFTPCP11686 197 aa17.16■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSKP41240 450 aa17.16■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIK3CAP42336 1068 aa17.16■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INHBCP55103 352 aa17.16■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIK3R6Q5UE93 754 aa17.16■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PM20D1Q6GTS8 502 aa17.16■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPOPLQ6IQ16 392 aa17.16■□□□□ 0.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNNM4Q6P4Q7 775 aa17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.9 ms