RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C21orf59P57076 290 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST8SIA6P61647 398 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHRS13Q6UX07 377 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GANCQ8TET4 914 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC17Q96AE7 1141 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRIG1Q96JA1 1093 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A18Q96N87 628 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL12Q9NXK8 326 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STIM2Q9P246 746 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERGEFQ9UGK8 458 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1257Q9ULG3 409 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PPC4 97 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM47DPA6NHR8 397 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIK3R2O00459 728 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VILLO15195 856 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF202O95125 648 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LTFP02788 710 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASLP04424 464 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSKP41240 450 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBX4P57082 545 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRMPQ12912 555 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CST6Q15828 149 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NADSYN1Q6IA69 706 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMF1Q6P1K2 205 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM270Q6UE05 265 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCUBE3Q8IX30 993 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FIBINQ8TAL6 211 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35F5Q8WV83 523 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFAP2BQ92481 460 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AZIN2Q96A70 460 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC34Q96HJ3 373 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRGPRX3Q96LB0 322 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSG101Q99816 390 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 URB1O60287 2271 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087WV48 116 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PP55 124 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E9PAM4 449 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0QYV0 167 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MID1O15344 667 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABBR2O75899 941 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAEPP09466 180 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRCPP42785 496 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALCP54803 685 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH18Q13634 790 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCEH1Q6PIU2 408 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDM1BQ8NB78 822 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLEC4CQ8WTT0 213 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35C1Q96A29 364 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SKA1Q96BD8 255 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYEOVQ96EZ4 313 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINB11Q96P15 392 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EBF2Q9HAK2 575 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RMND1Q9NWS8 449 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FZD4Q9ULV1 537 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC9Q9Y397 364 aa13.66□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC72A6NJI9 287 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT1P04628 370 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS24P62847 133 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNOCQ13519 176 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARID5BQ14865 1188 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STILQ15468 1287 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COBLL1Q53SF7 1204 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMPRSS12Q86WS5 348 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GATAD2AQ86YP4 633 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARNMT1Q8N4J0 409 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2T34Q8NGX1 318 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSFY1Q96LI6 401 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OMDQ99983 421 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSWIM1Q9BR11 485 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEUROG2Q9H2A3 272 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa13.65□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITIH6Q6UXX5 1313 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C10orf142B7Z368 130 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLK4O00444 970 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENC1O14682 589 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFPL3O75679 317 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO21O94952 628 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms