RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 ARL4CP56559 192 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SMARCB1Q12824 385 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ORC1Q13415 861 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GPM6BQ13491 265 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ACAP2Q15057 778 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KCTD21Q4G0X4 260 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 BOLA3Q53S33 107 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIQKQ629K1 86 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 LAYNQ6UX15 382 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C17orf99Q6UX52 265 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C16orf62Q7Z3J2 963 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 OR8H2Q8N162 312 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF507Q8TCN5 953 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF384Q8TF68 577 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 HAS1Q92839 578 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RRN3Q9NYV6 651 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1W2PQY0 241 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM187AA6NFU0 413 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 E5RI56 91 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ENC1O14682 589 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 AKAP10O43572 662 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FGF19O95750 216 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 EOMESO95936 686 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 IL6P05231 212 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RHOCP08134 193 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 HDCP19113 662 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 COPS2P61201 443 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ROR1Q01973 937 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC12A1Q13621 1099 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP1A4Q13733 1029 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C6orf10Q5SRN2 563 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RETSATQ6NUM9 610 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL17Q6TDP4 642 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 LRIG3Q6UXM1 1119 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DSG4Q86SJ6 1040 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 HSD17B14Q9BPX1 270 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL3Q9UH77 587 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DCTN4Q9UJW0 460 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 VAV3Q9UKW4 847 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 IRS2Q9Y4H2 1338 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PIPSLA2A3N6 862 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PSMD3O43242 534 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TEX33O43247 280 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MTSS1O43312 755 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FGGP02679 453 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 IFNA16P05015 189 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 APOA4P06727 396 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 BDNFP23560 247 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CDC25CP30307 473 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CCT8P50990 548 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GJA9P57773 515 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ABATP80404 500 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 STAT4Q14765 748 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DGUOKQ16854 277 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 EPC2Q52LR7 807 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PDZK1Q5T2W1 519 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 WSCD1Q658N2 575 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CENPPQ6IPU0 288 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA0408Q6ZU52 694 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MINDY2Q8NBR6 621 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIB2Q92519 343 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 JADE3Q92613 823 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms