RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 MLH1P40692 756 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 SLC25A3Q00325 362 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 DSG1Q02413 1049 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 ADIGQ0VDE8 80 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 PPM1JQ5JR12 505 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 SPANXN3Q5MJ09 141 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 RABGAP1LQ5R372 815 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 GRTP1Q5TC63 336 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CES3Q6UWW8 571 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 IZUMO2Q6UXV1 221 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 KBTBD2Q8IY47 623 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 ZNF567Q8N184 647 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 POU5F2Q8N7G0 328 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 APPL2Q8NEU8 664 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 OPTNQ96CV9 577 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CERS2Q96G23 380 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CPNE1Q99829 537 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 PNPOQ9NVS9 261 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 KAT6AQ92794 2004 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 SMIM24O75264 130 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 DAB1O75553 588 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 MYL4P12829 197 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CPOXP36551 454 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 IDH3AP50213 366 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 GSTA3Q16772 222 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CCDC153Q494R4 210 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 TMCO4Q5TGY1 634 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 PDPK2PQ6A1A2 396 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 PID1Q7Z2X4 250 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 RSPH3Q86UC2 560 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 PIGZQ86VD9 579 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 GSTCDQ8NEC7 633 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 TNIP3Q96KP6 325 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 TSC22D3Q99576 134 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 PRDM12Q9H4Q4 367 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 TMEM216Q9P0N5 145 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 STAP1Q9ULZ2 295 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 MCM3APO60318 1980 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 A0A088AWK7 358 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 E2F8A0AVK6 867 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 ENO4A6NNW6 628 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CPA3P15088 417 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 AKAP5P24588 427 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 SERPINB8P50452 374 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 NME3Q13232 169 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 ITGA9Q13797 1035 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 ZNF792Q3KQV3 632 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CFAP157Q5JU67 520 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 ZNF618Q5T7W0 954 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CMTM5Q96DZ9 223 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 SORT1Q99523 831 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 SNX15Q9NRS6 342 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 SETD4Q9NVD3 440 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 IGSF9Q9P2J2 1179 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP13.43□□□□□ -0.264e-6■■■□□ 15.7
PRAME-201ENST00000398741 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 M0QYT0 321 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 XPOTO43592 962 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 HUS1O60921 280 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 NOS2P35228 1153 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 SPRP35270 261 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 PNPLA4P41247 253 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 TAF6P49848 677 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 AAGABQ6PD74 315 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CDCA5Q96FF9 252 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 OSMRQ99650 979 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 ECSITQ9BQ95 431 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 LRRC40Q9H9A6 602 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 ADAM28Q9UKQ2 775 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 PPM1HQ9ULR3 514 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 IQCA1LA6NCM1 817 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 PIRO00625 290 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 SPTLC1O15269 473 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 USP1O94782 785 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 TKTP29401 623 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CDK7P50613 346 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CACNA2D1P54289 1103 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 EPHB1P54762 984 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 CCNA1P78396 465 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-201ENST00000398741 DEUP1Q05D60 604 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms