RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 PAGE1O75459 146 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 SUPT3HO75486 399 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 ERCC2P18074 760 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 NFKB1P19838 968 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 WEE1P30291 646 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 PTP4A2Q12974 167 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 KCNMB4Q86W47 210 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 MAGEA9P43362 315 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 CDH17Q12864 832 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 AUHQ13825 339 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 C17orf99Q6UX52 265 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 OSTM1Q86WC4 334 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 FNIP1Q8TF40 1166 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 ERP27Q96DN0 273 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 LRGUKQ96M69 825 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC160A6NGH7 325 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 RHOBTB1O94844 696 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 PBX3P40426 434 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 GDF10P55107 478 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 RHOAP61586 193 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 KDSRQ06136 332 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 BIRC2Q13490 618 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 STRADAQ7RTN6 431 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM199Q8N511 208 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 TTPALQ9BTX7 342 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 BRD8Q9H0E9 1235 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 ATP13A1Q9HD20 1204 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 LMCD1Q9NZU5 365 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 DNMT3LQ9UJW3 386 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 TRIM33Q9UPN9 1127 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 PKP3Q9Y446 797 aa10.27□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1W2PQY0 241 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 ST8SIA6P61647 398 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 LAMB3Q13751 1172 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 SPANXN3Q5MJ09 141 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 LPCAT1Q8NF37 534 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 TCP10LQ8TDR4 215 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 MTBPQ96DY7 904 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 WWP1Q9H0M0 922 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 RNF186Q9NXI6 227 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 DCDC2Q9UHG0 476 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 CDY1Q9Y6F8 540 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 SPTLC1O15269 473 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 ABCG1P45844 678 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 GBE1Q04446 702 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 MGAT5Q09328 741 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 FOXR1Q6PIV2 292 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 SRLQ86TD4 932 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 PLD5Q8N7P1 536 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 ACBD6Q9BR61 282 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 BCAP29Q9UHQ4 241 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 GLRA3O75311 464 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 SLC8A1P32418 973 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 OR1D2P34982 312 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 TPGS1Q6ZTW0 290 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 CLEC20AQ6ZU45 233 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 SLC26A9Q7LBE3 791 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 MCRS1Q96EZ8 462 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 XYLT2Q9H1B5 865 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 ADAM28Q9UKQ2 775 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 C2orf81A6NN90 581 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 FOXO6A8MYZ6 492 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 H0Y3Z8 333 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 SOCS7O14512 581 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 ARHGAP17Q68EM7 881 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 APBB2Q92870 758 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 PTPRHQ9HD43 1115 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 FZD10Q9ULW2 581 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 PCDHB8Q9UN66 801 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 USH1CQ9Y6N9 552 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 ATP5HO75947 161 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 CCNB1P14635 433 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 MMP13P45452 471 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 ANKRD22Q5VYY1 191 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 LMNTD2Q8IXW0 634 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 KIF2BQ8N4N8 673 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 LZTR1Q8N653 840 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 PGM2Q96G03 612 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 FAM96AQ9H5X1 160 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 DYRK4Q9NR20 520 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa10.26□□□□□ -0.77
TTPAL-202ENST00000372904 SLC25A13Q9UJS0 675 aa10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms