RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369875.3

CNNM2-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM2, Length 2,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM2-201ENST00000369875 E7ESA3 106 aa25.33■■□□□ 1.65
CNNM2-201ENST00000369875 E9PAM4 449 aa25.33■■□□□ 1.65
CNNM2-201ENST00000369875 NCAM2O15394 837 aa25.33■■□□□ 1.65
CNNM2-201ENST00000369875 SLC2A3P11169 496 aa25.33■■□□□ 1.65
CNNM2-201ENST00000369875 SSTR1P30872 391 aa25.33■■□□□ 1.65
CNNM2-201ENST00000369875 TUBP50607 506 aa25.33■■□□□ 1.65
CNNM2-201ENST00000369875 WASHC5Q12768 1159 aa25.33■■□□□ 1.65
CNNM2-201ENST00000369875 PIK3R6Q5UE93 754 aa25.33■■□□□ 1.65
CNNM2-201ENST00000369875 KDM7AQ6ZMT4 941 aa25.33■■□□□ 1.65
CNNM2-201ENST00000369875 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CNNM2-201ENST00000369875 MPP6Q9NZW5 540 aa25.33■■□□□ 1.65
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CNNM2-201ENST00000369875 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 DFFAO00273 331 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.645e-6■■□□□ 13.3
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CNNM2-201ENST00000369875 MX2P20592 715 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 GARSP41250 739 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 ZNF567Q8N184 647 aa25.32■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 PHACTR1Q9C0D0 580 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 VANGL2Q9ULK5 521 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 CLUHO75153 1309 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa25.32■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 CCDC38Q502W7 563 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 MANEALQ5VSG8 457 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 PID1Q7Z2X4 250 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 BADQ92934 168 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 TBK1Q9UHD2 729 aa25.32■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 PTPRSQ13332 1948 aa25.31■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 HDAC11Q96DB2 347 aa25.31■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 TTLL2Q9BWV7 592 aa25.31■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa25.3■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 TAF12Q16514 161 aa25.3■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa25.3■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 IGDCC3Q8IVU1 814 aa25.3■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 ZBED2Q9BTP6 218 aa25.3■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 NACA2Q9H009 215 aa25.3■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 NDFIP2Q9NV92 336 aa25.3■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 SHROOM3Q8TF72 1996 aa25.3■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa25.3■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 PRRG1O14668 218 aa25.3■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 AGTP01019 485 aa25.3■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 ALDH1A3P47895 512 aa25.3■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 MS4A13Q5J8X5 152 aa25.3■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 TPGS2Q68CL5 300 aa25.3■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa25.3■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa25.3■■□□□ 1.64
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CNNM2-201ENST00000369875 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 TPSB2P20231 275 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 HTR7P34969 479 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 PPM1AP35813 382 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 GRIA1P42261 906 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 SKOR1P84550 965 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 TPSAB1Q15661 275 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 ARTNQ5T4W7 220 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 RAP1GAP2Q684P5 730 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 SRLQ86TD4 932 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 C1orf74Q96LT6 269 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 AGAP3Q96P47 875 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 KIAA1671Q9BY89 1806 aa25.28■■□□□ 1.64
CNNM2-201ENST00000369875 CSPG5O95196 566 aa25.28■■□□□ 1.64
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