RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 DPH1Q9BZG8 443 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 FANCIQ9NVI1 1328 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 CES2O00748 559 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 TOMM40O96008 361 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 ALPLP05186 524 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 TM4SF4P48230 202 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 PRKAG1P54619 331 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 BCAT1P54687 386 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 FGL2Q14314 439 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 MLC1Q15049 377 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 SEC23BQ15437 767 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 AWAT1Q58HT5 328 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 CERCAMQ5T4B2 595 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 MXD3Q9BW11 206 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 CD209Q9NNX6 404 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 PSME4Q14997 1843 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 COL4A1P02462 1669 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 GRM8O00222 908 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 PSMD9O00233 223 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 PLIN1O60240 522 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 TAF5LO75529 589 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 ALDH1L1O75891 902 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 RNF8O76064 485 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 IL1R1P14778 569 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF91Q05481 1191 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 CTBP1Q13363 440 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 TNFAIP1Q13829 316 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 CCNIQ14094 377 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 PTCHD3Q3KNS1 767 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 CCDC184Q52MB2 194 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM63BQ5T3F8 832 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 BEND3Q5T5X7 828 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 LYZL4Q96KX0 146 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 DEFB129Q9H1M3 183 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM184CQ9NVA4 438 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 WWOXQ9NZC7 414 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 HEY2Q9UBP5 337 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 STAP2Q9UGK3 403 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-204ENST00000367379 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 DIO1P49895 249 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 ID2Q02363 134 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 PRKG1Q13976 671 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 UBE4AQ14139 1066 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 MOB2Q70IA6 237 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 VEZTQ9HBM0 779 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 POT1Q9NUX5 634 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 FAM205AQ6ZU69 1335 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 MROH5Q6ZUA9 1318 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 SNAP23O00161 211 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 BTN3A1O00481 513 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 FAM90A13PP0C7W8 464 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 FAM90A24PP0C7X0 464 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 CTSAP10619 480 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 PSG1P11464 419 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 KLRK1P26718 216 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 ARHGEF6Q15052 776 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 ANO7Q6IWH7 933 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF783Q6ZMS7 281 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 SPEF2Q9C093 1822 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 CLRN2A0PK11 232 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 SPRY2O43597 315 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 HTR6P50406 440 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 ERV3-1Q14264 604 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 CAVIN4Q5BKX8 364 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM65Q6PI78 240 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 RANBP10Q6VN20 620 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-204ENST00000367379 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms