RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANP32CO43423 234 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 NARSO43776 548 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMPRSS11DO60235 418 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 USO1O60763 962 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 GJB3O75712 270 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 BAIAP3O94812 1187 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TJP3O95049 919 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF202O95125 648 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 F9P00740 461 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 URODP06132 367 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 RFPL3SP0C7P2 107 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRKCHP24723 683 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ICAM3P32942 547 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAN1A1P33908 653 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 IDUAP35475 653 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDIT3P35638 169 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PNPLA4P41247 253 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDK7P50613 346 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCR9P51686 369 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 EFNA5P52803 228 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 DCAF7P61962 342 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TLE3Q04726 772 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MPP3Q13368 585 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CBFBQ13951 182 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 NAA25Q14CX7 972 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTPAQ15257 358 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 RUNDC3AQ59EK9 446 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MIIPQ5JXC2 388 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARMC6Q6NXE6 501 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP51Q70EK9 711 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 RTL10Q7L3V2 364 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MDGA2Q7Z553 956 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCN4BQ8IWT1 228 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM217Q8N7C4 229 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINC01465Q8N7H1 131 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLD5Q8N7P1 536 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TERB1Q8NA31 727 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ABHD11Q8NFV4 315 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 GLMPQ8WWB7 406 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 REPS1Q96D71 796 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PERPQ96FX8 193 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 EYA3Q99504 573 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRDM13Q9H4Q3 707 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SNX15Q9NRS6 342 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SH3BP4Q9P0V3 963 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRIT1Q9P2V4 623 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERGEFQ9UGK8 458 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC13A4Q9UKG4 626 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 NFU1Q9UMS0 254 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SH2B3Q9UQQ2 575 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 GDAQ9Y2T3 454 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIAS3Q9Y6X2 628 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 COL4A3Q01955 1670 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A0A0MQY5 61 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CXorf65A6NEN9 183 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PER2O15055 1255 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TGFB1I1O43294 461 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 AHCYL1O43865 530 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 DOK2O60496 412 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNTN5O94779 1100 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ONECUT2O95948 504 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TUBB4AP04350 444 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADH4P08319 380 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 HKR1P10072 659 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MMP8P22894 467 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TYK2P29597 1187 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC8A1P32418 973 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 YPEL5P62699 121 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 VAMP2P63027 116 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ERV3-1Q14264 604 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 IL13RA2Q14627 380 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNB1Q14721 858 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNGA3Q16281 694 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBRG1Q3YBR2 411 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 GXYLT1Q4G148 440 aa2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms