RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PCID2Q5JVF3 399 aa16.61■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ACTR8Q9H981 624 aa16.61■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CYP4F12Q9HCS2 524 aa16.61■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHST7Q9NS84 486 aa16.61■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLUHO75153 1309 aa16.61■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DISP2A7MBM2 1401 aa16.61■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GSNP06396 782 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GALNTL6Q49A17 601 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ANKRD52Q8NB46 1076 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 REPS1Q96D71 796 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLA2G4CQ9UP65 541 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FCHO1O14526 889 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SSTR1P30872 391 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CRYMQ14894 314 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LPCAT1Q8NF37 534 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 F8VP50 259 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF23P17027 643 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PSMA3P25788 255 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM171A1Q5VUB5 890 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMEM150BA6NC51 233 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 E9PBE3 544 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KLHL41O60662 606 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ADCYAP1R1P41586 468 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ERFP50548 548 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FMO1Q01740 532 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C4orf32Q8N8J7 132 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OTULINQ96BN8 352 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NR5A2O00482 541 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FSCN2O14926 492 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR56A5P0C7T3 313 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RBL1P28749 1068 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DLG4P78352 724 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AGKQ53H12 422 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GPR141Q7Z602 305 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ART4Q93070 314 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CDT1Q9H211 546 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CROTQ9UKG9 612 aa16.6■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AMHP03971 560 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PBX1P40424 430 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GRM5P41594 1212 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MMP13P45452 471 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CAPSQ13938 189 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC25A23Q9BV35 468 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TKTL2Q9H0I9 626 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF862O60290 1169 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KATNA1O75449 491 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CKBP12277 381 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NOMO3P69849 1222 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FTHL17Q9BXU8 183 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ADM5C9JUS6 153 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PTPN3P26045 913 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 XRCC4Q13426 336 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NR6A1Q15406 480 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MICU2Q8IYU8 434 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RNF157Q96PX1 679 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.254e-8■■□□□ 12.3
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CXorf56Q9H5V9 222 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF839A8K0R7 811 aa16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RPN2P04844 631 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms