RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CDRT15Q96T59 188 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SERPINI1Q99574 410 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ARMC7Q9H6L4 198 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SQORQ9Y6N5 450 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 APOEP02649 317 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SERPINE1P05121 402 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CALB1P05937 261 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 OCM2P0CE71 109 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 KDELR1P24390 212 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PKNOX1P55347 436 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ZNF606Q8WXB4 792 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PORCNQ9H237 461 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ANLNQ9NQW6 1124 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa17.23■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ARHGEF37A1IGU5 675 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 C7orf72A4D263 438 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PSMA2P25787 234 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CDH15P55291 814 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 MS4A2Q01362 244 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB33Q86T24 672 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 TMED5Q9Y3A6 229 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 NR2E3Q9Y5X4 410 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 NOP56O00567 594 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FUCA1P04066 466 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 OSBPP22059 807 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SERPINB5P36952 375 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ROR1Q01973 937 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FSCBQ5H9T9 825 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 NPNTQ6UXI9 565 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 UNC5AQ6ZN44 842 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 DCDC5Q6ZRR9 648 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CHADO15335 359 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 LRCH4O75427 683 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 APOC2P02655 101 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PCLAFQ15004 111 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ZNF423Q2M1K9 1284 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PPM1LQ5SGD2 360 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CCDC80Q76M96 950 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 C10orf107Q8IVU9 208 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 EME1Q96AY2 570 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ISOC1Q96CN7 298 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FAM96AQ9H5X1 160 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 MYRFQ9Y2G1 1151 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 FADS3Q9Y5Q0 445 aa17.22■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 H3BNH8 94 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CFLARO15519 480 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 TNFSF9P41273 254 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 BCAP31P51572 246 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 CTBSQ01459 385 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 NIPA2Q8N8Q9 360 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 KLHL32Q96NJ5 620 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 NUB1Q9Y5A7 615 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SSC5DA1L4H1 1573 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 KRT80Q6KB66 452 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 OLFML1Q6UWY5 402 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 SNX32Q86XE0 403 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 DSELQ8IZU8 1212 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PCYT2Q99447 389 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 TCHPQ9BT92 498 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 PCSK1NQ9UHG2 260 aa17.21■□□□□ 0.35
GDE1-201ENST00000353258 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 H0YCG3 227 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 K7EPI3 171 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 PLIN3O60664 434 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 KRT7P08729 469 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 HMOX2P30519 316 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 NAMPTP43490 491 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 CAPSQ13938 189 aa17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms