RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT9P35527 623 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF25-201ENST00000348333 DPP6P42658 865 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF25-201ENST00000348333 KLK7P49862 253 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF25-201ENST00000348333 IRAK1P51617 712 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPS14P62263 151 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDH18Q13634 790 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF25-201ENST00000348333 PITRM1Q5JRX3 1037 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF25-201ENST00000348333 TAF3Q5VWG9 929 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF25-201ENST00000348333 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF25-201ENST00000348333 APCDD1Q8J025 514 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF25-201ENST00000348333 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 MEI4A8MW99 385 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 DAB1O75553 588 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 GLI1P08151 1106 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACADMP11310 421 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 PMLP29590 882 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACSL1P33121 698 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDK17Q00537 523 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 E2F5Q15329 346 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 C2CD6Q53TS8 623 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 DCAF12L1Q5VU92 463 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 DEFB124Q8NES8 71 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 CEP76Q8TAP6 659 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 UCHL3P15374 230 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 CYP11B1P15538 503 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC6A3Q01959 620 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 CENPCQ03188 943 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 NME3Q13232 169 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLEKHG6Q3KR16 790 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDKAL1Q5VV42 579 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC26A9Q7LBE3 791 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 MINDY1Q8N5J2 469 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNASE2BQ8WZ79 361 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 FOXJ1Q92949 421 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 VPS16Q9H269 839 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 GANQ9H2C0 597 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANLNQ9NQW6 1124 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHD8Q9HCK8 2581 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 TPRP12270 2363 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 F5H5T6 163 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 H0Y626 953 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 SIN3BO75182 1162 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 C7P10643 843 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT31Q15323 416 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYCP2LQ5T4T6 812 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR52K2Q8NGK3 314 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGSF8Q969P0 613 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 NOX5Q96PH1 765 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUP58Q9BVL2 599 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYNCQ9H7C4 482 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ERVW-1Q9UQF0 538 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACACBO00763 2458 aa23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCNX2A6NKB5 2137 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 METTL12A8MUP2 240 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 TTC34A8MYJ7 566 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 F8VZ95 297 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 I6L893 689 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARHGAP33O14559 1287 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 EPHB6O15197 1021 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 OXTRP30559 389 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 STK19P49842 368 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 FBXL22Q6P050 247 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 CADM4Q8NFZ8 388 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 RNF34Q969K3 372 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIGVQ9NUD9 493 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNX10Q9Y5X0 201 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 DOCK4Q8N1I0 1966 aa23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 M0QYT0 321 aa23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASLP04424 464 aa23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDGFRAP16234 1089 aa23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ABCB4P21439 1286 aa23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCR1P32246 355 aa23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 SEMA3BQ13214 749 aa23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF25-201ENST00000348333 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms