RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 MPP7Q5T2T1 576 aa28.65■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 RFX8Q6ZV50 586 aa28.65■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 TSC1Q92574 1164 aa28.65■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 IGSF8Q969P0 613 aa28.65■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 CSPG4P5Q96PW8 444 aa28.65■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 CARD9Q9H257 536 aa28.65■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 RETREG1Q9H6L5 497 aa28.65■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa28.65■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 DHCR24Q15392 516 aa28.64■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 LY6G5CQ5SRR4 150 aa28.64■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 SYT10Q6XYQ8 523 aa28.64■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 SLC44A3Q8N4M1 653 aa28.64■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 CPA6Q8N4T0 437 aa28.64■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 MARK1Q9P0L2 795 aa28.64■■■□□ 2.18
GIPC1-201ENST00000345425 CASQ1P31415 396 aa28.63■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 RPS24P62847 133 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 NR1H3Q13133 447 aa28.63■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 TFDP3Q5H9I0 405 aa28.63■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 RHBDF2Q6PJF5 856 aa28.63■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 MFSD7Q6UXD7 560 aa28.63■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa28.63■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM25Q86YD3 366 aa28.63■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 MYEOVQ96EZ4 313 aa28.63■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 NEU3Q9UQ49 428 aa28.63■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ESPNB1AK53 854 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 TBL1XO60907 577 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 CYP17A1P05093 508 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ARSAP15289 507 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 IL4RP24394 825 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 MMRN1Q13201 1228 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 RUNX3Q13761 415 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ANO4Q32M45 955 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 SEL1L2Q5TEA6 688 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 CFAP52Q8N1V2 620 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 FAF2Q96CS3 445 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 BBS2Q9BXC9 721 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ECT2Q9H8V3 914 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 HPS4Q9NQG7 708 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 DONSONQ9NYP3 566 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GVM2 712 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 TCAF2A6NFQ2 919 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ASGR2P07307 311 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 PYGMP11217 842 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 BMP1P13497 986 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 RHOQP17081 205 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 CDKN2BP42772 138 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 SGSHP51688 502 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 CDH4P55283 916 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 GAD2Q05329 585 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 DPYSQ14117 519 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 PPP2R5EQ16537 467 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ARTNQ5T4W7 220 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 DCAF12L1Q5VU92 463 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 CHST9Q7L1S5 443 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 PSMB7Q99436 277 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 MPP6Q9NZW5 540 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 DOCK4Q8N1I0 1966 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 CLDN11O75508 207 aa28.61■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ADH5P11766 374 aa28.61■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 TAZQ16635 292 aa28.61■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 FYB2Q5VWT5 728 aa28.61■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa28.61■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF4Q9NR80 690 aa28.61■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 SNX12Q9UMY4 172 aa28.61■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 C19orf67A6NJJ6 358 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ARNTLO00327 626 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 PENKP01210 267 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 PTPN7P35236 360 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 TNK2Q07912 1038 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 TDGQ13569 410 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 BHMTQ93088 406 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 RNF157Q96PX1 679 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 CNTN5O94779 1100 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 IRAK1P51617 712 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ALFQ53S48 1182 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 PBKQ96KB5 322 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 TRPV5Q9NQA5 729 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM248Q9NWD8 314 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 PLK2Q9NYY3 685 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 EFR3BQ9Y2G0 817 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 WASH4PA8MWX3 477 aa28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 TYRP14679 529 aa28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 TCP1P17987 556 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ERCC2P18074 760 aa28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms