RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.51□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 TMEM165Q9HC07 324 aa10.51□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 STOML1Q9UBI4 398 aa10.51□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 IRAK3Q9Y616 596 aa10.51□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 GMEB1Q9Y692 573 aa10.51□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 VPS13AQ96RL7 3174 aa10.51□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 TMEM120BA0PK00 339 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 TNFRSF10BO14763 440 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 HGSO14964 777 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 ADAM12O43184 909 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 ENTPD5O75356 428 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 LMNAP02545 664 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 ATF2P15336 505 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 RPL17P18621 184 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 SDC4P31431 198 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 BMP8BP34820 402 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 PLTPP55058 493 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 ERVK-21P61565 698 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 DUSP4Q13115 394 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 RAB30Q15771 203 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 MGAT5BQ3V5L5 792 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 BEND5Q7L4P6 421 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 FBXO25Q8TCJ0 367 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 SPPL3Q8TCT6 385 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 RXFP2Q8WXD0 754 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 HAPLN3Q96S86 360 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 SLX1AQ9BQ83 275 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 RRN3Q9NYV6 651 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 IL37Q9NZH6 218 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 MSRAQ9UJ68 235 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 PATJQ8NI35 1801 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 GRXCR1A8MXD5 290 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 PSTPIP1O43586 416 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 DAB1O75553 588 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 VNN2O95498 520 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 C1RP00736 705 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 USP17L7P0C7H9 530 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 MATKP42679 507 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 PTPN9P43378 593 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 SLC5A3P53794 718 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 DR1Q01658 176 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 LSAMPQ13449 338 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 DDR2Q16832 855 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 HADHQ16836 314 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 LRRC38Q5VT99 294 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 LRRC8CQ8TDW0 803 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 CD101Q93033 1021 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 FAM149B1Q96BN6 582 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 SPATA16Q9BXB7 569 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 POPDC2Q9HBU9 364 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 TLR9Q9NR96 1032 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 SCML2Q9UQR0 700 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa10.5□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 FAM187AA6NFU0 413 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 GRAP2O75791 330 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 ADH1AP07327 375 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 CA3P07451 260 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 MYOGP15173 224 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 CREB1P16220 341 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 DNAJB2P25686 324 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 TARSP26639 723 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 NOS2P35228 1153 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 OGDHQ02218 1023 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 TAF5Q15542 800 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 SNX30Q5VWJ9 437 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 RHOT1Q8IXI2 618 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 TCEAL8Q8IYN2 117 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 EMC1Q8N766 993 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 CLEC4CQ8WTT0 213 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 POF1BQ8WVV4 589 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 NRG4Q8WWG1 115 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 GRAMD1AQ96CP6 724 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 SLC2A13Q96QE2 648 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 C17orf80Q9BSJ5 609 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 HAO1Q9UJM8 370 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 STAP1Q9ULZ2 295 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 USTQ9Y2C2 406 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 TEX28O15482 410 aa10.49□□□□□ -0.73
GINS3-201ENST00000318129 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms