RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC7A4O43246 635 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SIGLEC6O43699 453 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 OPA1O60313 960 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOC3O60645 756 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KLKB1P03952 638 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGB2P05107 769 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 GP1BBP13224 206 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-FP30511 346 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC8A1P32418 973 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 AFMP43652 599 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC11A2P49281 568 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 BNIP3Q12983 259 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SERINC3Q13530 473 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SHBQ15464 509 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PROX2Q3B8N5 592 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRF1Q5T601 910 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 USP53Q70EK8 1073 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF366Q8N895 744 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4C6Q8NH72 309 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK15Q8TD08 544 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ORAI3Q9BRQ5 295 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TNMDQ9H2S6 317 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CUEDC2Q9H467 287 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP3A43Q9HB55 503 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NMUR1Q9HB89 426 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 OSER1Q9NX31 292 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NME7Q9Y5B8 376 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 BPTFQ12830 3046 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PR77 199 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ENO4A6NNW6 628 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BM21 787 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MID1O15344 667 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PPFIA2O75334 1257 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 BEST1O76090 585 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 WNT1P04628 370 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CKMT1AP12532 417 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ARID5BQ14865 1188 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM215Q68D42 235 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ADIPOR2Q86V24 386 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 MFN1Q8IWA4 741 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 GLMNQ92990 594 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 EPSTI1Q96J88 318 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP16Q9BY84 665 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SEPT10Q9P0V9 454 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKMY1Q9P2S6 941 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 USP3Q9Y6I4 520 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CLIC2O15247 247 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 LATO43561 262 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SDC3O75056 442 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SIN3BO75182 1162 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TCEA3O75764 348 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 IL1BP01584 269 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMD8P48556 350 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 RPIAP49247 311 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 PGFP49763 221 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ADPRHP54922 357 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 SULT2A1Q06520 285 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH18Q13634 790 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
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