RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ASLP04424 464 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 PAK1Q13153 545 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 CDH18Q13634 790 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 GLRX5Q86SX6 157 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 TAC4Q86UU9 113 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 SGK2Q9HBY8 427 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.33■□□□□ 0.85
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CXCL3-201ENST00000296026 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 SIN3BO75182 1162 aa20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 TEAD4Q15561 434 aa20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 KIF19Q2TAC6 998 aa20.32■□□□□ 0.84
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CXCL3-201ENST00000296026 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 BEND5Q7L4P6 421 aa20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 STK32AQ8WU08 396 aa20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.32■□□□□ 0.84
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CXCL3-201ENST00000296026 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.32■□□□□ 0.84
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CXCL3-201ENST00000296026 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 SCML1Q9UN30 329 aa20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 SNX11Q9Y5W9 270 aa20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 CHD6Q8TD26 2715 aa20.32■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 MED7O43513 233 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 APOEP02649 317 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 CD27P26842 260 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 GRIA4P48058 902 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 MEA1Q16626 185 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 USP30Q70CQ3 517 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.31■□□□□ 0.84
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CXCL3-201ENST00000296026 LGI2Q8N0V4 545 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 GANCQ8TET4 914 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.31■□□□□ 0.84
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CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.31■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 E5RJQ4 531 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 FLRT2O43155 660 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 THAP12O43422 761 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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CXCL3-201ENST00000296026 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 LAYNQ6UX15 382 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM110Q86TL2 294 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 CHSY1Q86X52 802 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 KDM1BQ8NB78 822 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 ACP6Q9NPH0 428 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM131Q92545 1883 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 TTC34A8MYJ7 566 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 MOCS3O95396 460 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 TACR2P21452 398 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 GNA15P30679 374 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 ARID5BQ14865 1188 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 CST6Q15828 149 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA0895LQ68EN5 471 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 MED15Q96RN5 788 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 THAP9Q9H5L6 903 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 CEP83Q9Y592 693 aa20.29■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 KCNK3O14649 394 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 MID1O15344 667 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 IGLV3-25P01717 112 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 IGHV4-34P06331 123 aa20.28■□□□□ 0.84
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