RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 GRID2IPA4D2P6 1211 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 COMTP21964 271 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 IRAK1P51617 712 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CA9Q16790 459 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 SMTNL2Q2TAL5 461 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM196Q5HYL7 178 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 KCNT1Q5JUK3 1230 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF852Q6ZMS4 543 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 DAAM2Q86T65 1068 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 SIX5Q8N196 739 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CFAP52Q8N1V2 620 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 PYROXD2Q8N2H3 581 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC57Q8N9N7 239 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 FAM71BQ8TC56 605 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 FAM3CQ92520 227 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CD101Q93033 1021 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 BHMTQ93088 406 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D31Q96DN5 1066 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 EPAS1Q99814 870 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 P2RY13Q9BPV8 354 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ZYG11BQ9C0D3 744 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 GOLPH3Q9H4A6 298 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ZWILCHQ9H900 591 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 DEC1Q9P2X7 70 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF212Q9UDV6 495 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 CLEC4EQ9ULY5 219 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa13.65□□□□□ -0.22
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0A0MRY4 1105 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 KANSL1LA0AUZ9 987 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PSTPIP1O43586 416 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 SPOPO43791 374 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 SRGAP2O75044 1071 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CLDN11O75508 207 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 MOCS3O95396 460 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CISD3P0C7P0 127 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 SSR1P43307 286 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 SLC6A11P48066 632 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ARSEP51690 589 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CDH4P55283 916 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ALFQ53S48 1182 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 GRAMD4Q6IC98 578 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 MFN1Q8IWA4 741 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 RHOT1Q8IXI2 618 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 SYCE1Q8N0S2 351 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 NAT16Q8N8M0 369 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 FIBINQ8TAL6 211 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA1524Q8TCG1 905 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PNKPQ96T60 521 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 STIM2Q9P246 746 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa13.64□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ZSCAN12O43309 604 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CNTN5O94779 1100 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 RHOQP17081 205 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 DRD1P21728 446 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 HLA-FP30511 346 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 HCAR3P49019 387 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 DGKGP49619 791 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 GALK1P51570 392 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CDH18Q13634 790 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PON2Q15165 354 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 NLRP14Q86W24 1093 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 TERB1Q8NA31 727 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 WFDC5Q8TCV5 224 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 TSC1Q92574 1164 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 HSPH1Q92598 858 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 LMLNQ96KR4 655 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 NELL2Q99435 816 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 OSBPL6Q9BZF3 934 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D17Q9HA65 648 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PCDH18Q9HCL0 1135 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 LTB4R2Q9NPC1 389 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 LZTFL1Q9NQ48 299 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ARHGEF4Q9NR80 690 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM248Q9NWD8 314 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 MPP6Q9NZW5 540 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 GUCA1BQ9UMX6 200 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 HYOU1Q9Y4L1 999 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CUL9Q8IWT3 2517 aa13.63□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM221A6NGB7 291 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 WASH4PA8MWX3 477 aa13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms