RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 PIK3R1P27986 724 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CCR10P46092 362 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 GABRB2P47870 512 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 NEDD8Q15843 81 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ARCQ7LC44 396 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 DSELQ8IZU8 1212 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 RNF169Q8NCN4 708 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 DDI1Q8WTU0 396 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 AP4E1Q9UPM8 1137 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ADCY6O43306 1168 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PLIN3O60664 434 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TRIM13O60858 407 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SPDYE6P0CI01 402 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 AGKQ53H12 422 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 KIF12Q96FN5 646 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CNDP1Q96KN2 507 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 POPDC2Q9HBU9 364 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PSAT1Q9Y617 370 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CHRNGP07510 517 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TFPTP0C1Z6 253 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PSMB4P28070 264 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 NAA20P61599 178 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 DCAF6Q58WW2 860 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 MTX3Q5HYI7 312 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TAS1R3Q7RTX0 852 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 XYLT1Q86Y38 959 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 OR52K1Q8NGK4 314 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 HSD17B4P51659 736 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CAPSQ13938 189 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 MYBPC3Q14896 1274 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CMPK2Q5EBM0 449 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PTTG2Q9NZH5 202 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 COPG2Q9UBF2 871 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ATP6AP2O75787 350 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TSPAN8P19075 237 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 NIM1KQ8IY84 436 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ADGRF2Q8IZF7 708 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ZFP28Q8NHY6 868 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 GIPC3Q8TF64 312 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 MAGEB5Q9BZ81 275 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CCDC90BQ9GZT6 254 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PCDHAC1Q9H158 963 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CHST12Q9NRB3 414 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SNX15Q9NRS6 342 aa15.66■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 NFICP08651 508 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 NR1H2P55055 460 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CNTN2Q02246 1040 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CPB2Q96IY4 423 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 NT5C1AQ9BXI3 368 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 GGA3Q9NZ52 723 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ITGA11Q9UKX5 1188 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 RNF103O00237 685 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ABCD1P33897 745 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 GP5P40197 560 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 AP3M2P53677 418 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SNX16P57768 344 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 MAP3K10Q02779 954 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 FBXL19Q6PCT2 694 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 WDTC1Q8N5D0 677 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CLEC4DQ8WXI8 215 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ING2Q9H160 280 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ZNF839A8K0R7 811 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PMM2O15305 246 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 LYPLA2O95372 231 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 GRIA2P42262 883 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 LPIN1Q14693 890 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 STILQ15468 1287 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 MYLK3Q32MK0 819 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 EEF1DP3Q658K8 133 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 FAM47BQ8NA70 645 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.65■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 AKT1S1Q96B36 256 aa15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms