RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 VANGL2Q9ULK5 521 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 DRGXA6NNA5 263 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 LMAN2Q12907 356 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CRY1Q16526 586 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 VPS36Q86VN1 386 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 MFN1Q8IWA4 741 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CARNMT1Q8N4J0 409 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ACDQ96AP0 544 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ZNF653Q96CK0 615 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CNPY3Q9BT09 278 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 THAP2Q9H0W7 228 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CD248Q9HCU0 757 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 GGA2Q9UJY4 613 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 WASH3PC4AMC7 463 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 MYBL1P10243 752 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 NBL1P41271 181 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 ENPP2Q13822 863 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CCDC185Q8N715 623 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 SORCS1Q8WY21 1168 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 SLC8A2Q9UPR5 921 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 R4GN57 208 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 DOCK4Q8N1I0 1966 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 LILRB5O75023 590 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CNTN5O94779 1100 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 SLC18A3Q16572 532 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 ALFQ53S48 1182 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CHST9Q7L1S5 443 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CNGA4Q8IV77 575 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 OR52K2Q8NGK3 314 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF26Q96DR7 871 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 HHIPQ96QV1 700 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 GABRG3Q99928 467 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN32Q9NX65 697 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQF6 199 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 FAM72CH0Y354 149 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CYP1A2P05177 515 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 TPM1P09493 284 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 NTSR1P30989 418 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 WASP42768 502 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 FNTBP49356 437 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 GALCP54803 685 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 PTPRNQ16849 979 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 FUT11Q495W5 492 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 FAM72AQ5TYM5 149 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 FAM72BQ86X60 149 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 AHI1Q8N157 1196 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 NTAN1Q96AB6 310 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 TTC17Q96AE7 1141 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 ALG14Q96F25 216 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 TRIM11Q96F44 468 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 EML5Q05BV3 1969 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GVM2 712 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 TCAF2A6NFQ2 919 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 E9PAM4 449 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 TIMM44O43615 452 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 IL12RB1P42701 662 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 SCAPQ12770 1279 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 EOGTQ5NDL2 527 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 MANEALQ5VSG8 457 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 MBLAC2Q68D91 279 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 NEU3Q9UQ49 428 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 SCINQ9Y6U3 715 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD62A6NC57 917 aa22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms