RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 IRGCQ6NXR0 463 aa26.99■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 LRRC8BQ6P9F7 803 aa26.99■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 STMN2Q93045 179 aa26.99■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 SPATA13Q96N96 652 aa26.99■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 RNF19AQ9NV58 838 aa26.99■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa26.99■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 PTGESO14684 152 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 GLRA3O75311 464 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 GBE1Q04446 702 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 NIPAL4Q0D2K0 466 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 RCN1Q15293 331 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 SV2CQ496J9 727 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 ANO7Q6IWH7 933 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 SCUBE3Q8IX30 993 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 FERMT1Q9BQL6 677 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 CCDC106Q9BWC9 280 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 SLC13A1Q9BZW2 595 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 RNF208Q9H0X6 261 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 FAM105AQ9NUU6 356 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 LRCH1Q9Y2L9 728 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 USP3Q9Y6I4 520 aa26.98■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 SDR42E2A6NKP2 422 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 SPTLC1O15269 473 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 STK10O94804 968 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 MUM1Q2TAK8 710 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 SYCP2LQ5T4T6 812 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 LHX8Q68G74 356 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 TTC7BQ86TV6 843 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 HTR3CQ8WXA8 447 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 PCMTD2Q9NV79 361 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 B2RBV5 119 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 H0Y3Z8 333 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 GPR182O15218 404 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 OPHN1O60890 802 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 FAM163BP0C2L3 166 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 SKIP12755 728 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 AP1B1Q10567 949 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 BMPR2Q13873 1038 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 C6orf163Q5TEZ5 329 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 SNX30Q5VWJ9 437 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 MECRQ9BV79 373 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 NMRK1Q9NWW6 199 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 DTLQ9NZJ0 730 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 DCDC2Q9UHG0 476 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 PLA2G4CQ9UP65 541 aa26.97■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 UGT1A9O60656 530 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 CABYRO75952 493 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 TM7SF2O76062 418 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 CTSHP09668 335 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 MYL4P12829 197 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 AOC1P19801 751 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 EFHC1Q5JVL4 640 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 ADGRF2Q8IZF7 708 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 PPFIBP2Q8ND30 876 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 OR6B3Q8NGW1 331 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 ATP2A3Q93084 1043 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 UGT1A7Q9HAW7 530 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 UGT1A10Q9HAW8 530 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 UGT1A8Q9HAW9 530 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 GPAMQ9HCL2 828 aa26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TPI1-201ENST00000229270 PGAM1P18669 254 aa26.95■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 ARL4AP40617 200 aa26.95■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 KLC1Q07866 573 aa26.95■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 KIRREL3Q8IZU9 778 aa26.95■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 FAM136AQ96C01 138 aa26.95■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 CIB2O75838 187 aa26.94■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 GRK2P25098 689 aa26.94■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 GLUD2P49448 558 aa26.94■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 AQP5P55064 265 aa26.94■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 FAM26DQ5JW98 314 aa26.94■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 MROH9Q5TGP6 573 aa26.94■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa26.94■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 TREML1Q86YW5 311 aa26.94■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 MPP5Q8N3R9 675 aa26.94■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 TOP6BLQ8N6T0 577 aa26.94■■□□□ 1.9
TPI1-201ENST00000229270 DEFB118Q96PH6 123 aa26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms