RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.26e-8■■■□□ 17.5
NME4-201ENST00000219479 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 F8VZ95 297 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 NDUFS2O75306 463 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 ENGP17813 658 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 CCR1P32246 355 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 DPP6P42658 865 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 SLC6A3Q01959 620 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 ENPP2Q13822 863 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 PTPN20Q4JDL3 420 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 MBLAC2Q68D91 279 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 LGI2Q8N0V4 545 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 GATA6Q92908 595 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 ATRXP46100 2492 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 F5H5T6 163 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 H0Y626 953 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 ACADMP11310 421 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 TACR2P21452 398 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 PRKCHP24723 683 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 CD70P32970 193 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 NME3Q13232 169 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 RAP1GAP2Q684P5 730 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 ERICH1Q86X53 443 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 CFAP52Q8N1V2 620 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 DEFB119Q8N690 84 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 FIBINQ8TAL6 211 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 BAHCC1Q9P281 2608 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 DSPP15924 2871 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 DAB1O75553 588 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 IGLV3-25P01717 112 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 DLDP09622 509 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 HLA-EP13747 358 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 ITPKAP23677 461 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 CACUL1Q86Y37 369 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 TMPRSS6Q8IU80 811 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 WFDC5Q8TCV5 224 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 SIPA1Q96FS4 1042 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 SPAG5Q96R06 1193 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 FSCN3Q9NQT6 498 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 FAM170AA1A519 330 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 TMEM8BA6NDV4 472 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 GFPT2O94808 682 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 MOCS3O95396 460 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 KLK7P49862 253 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 ST8SIA6P61647 398 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 MTA1Q13330 715 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 C18orf8Q96DM3 657 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 GANQ9H2C0 597 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 RRN3Q9NYV6 651 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 CFIP05156 583 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 NOS2P35228 1153 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 HOXD12P35452 270 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 TYRO3Q06418 890 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 PIP4P1Q86T03 277 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 NEK11Q8NG66 645 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 MYEOVQ96EZ4 313 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 SLC32A1Q9H598 525 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.193e-9■■■■■ 75.1
NME4-201ENST00000219479 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.48■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 LGALS16A8MUM7 142 aa22.48■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 M0QYT0 321 aa22.48■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 CD6P30203 668 aa22.48■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
NME4-201ENST00000219479 CSKP41240 450 aa22.48■■□□□ 1.19
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