RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105041.9

H2-Q1-202, Transcript of Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2-Q1, Length 1,954 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 CgasQ8C6L5 507 aa12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Vmn1r213Q8R278 384 aa12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cox18Q8VC74 331 aa12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Q8VDP2 222 aa12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fads1Q920L1 447 aa12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Trem2Q99NH8 227 aa12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 MagohbQ9CQL1 146 aa12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Themis3Q9CU24 569 aa12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pramef12Q9D2F1 463 aa12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Magel2Q9QZ04 1284 aa12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Vmn2r39L7N2E5 861 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ptger1P35375 405 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pdcd1Q02242 288 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 TceancQ3US16 359 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fbxw2Q60584 422 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Q6DFW0 481 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Wdr44Q6NVE8 915 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Proser3Q7TSA6 634 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Trpa1Q8BLA8 1125 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nipal4Q8BZF2 406 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Prr33Q8C494 260 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Olfr1353Q8VGU8 309 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc12a6Q924N4 1150 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Krt71Q9R0H5 524 aa12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kctd18E0CZ26 429 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Klc1O88447 541 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Aff1O88573 1216 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Hmga1P17095 107 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Wnt6P22727 364 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kif5cP28738 956 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ppp3ccP48455 513 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kcnn2P58390 839 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Stmn4P63042 189 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 SiaeP70665 541 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Wbp2P97765 261 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 AxlQ00993 888 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tespa1Q3U132 458 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PterQ60866 349 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ppp2r2aQ6P1F6 447 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rtl3Q6P1Y1 553 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Vtcn1Q7TSP5 283 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Efcab14Q8BGQ6 484 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 CcnyQ8BGU5 341 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tmem120aQ8C1E7 343 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pde10aQ8CA95 790 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gsto2Q8K2Q2 248 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sec63Q8VHE0 760 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PlvapQ91VC4 438 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PgcQ9D7R7 392 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 NumbQ9QZS3 653 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Map3k6Q9WTR2 1291 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm5538W4VSP6 401 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zc3h12bG3X9I7 835 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Man2b1O09159 1013 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nrg3O35181 713 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 ZfaP23607 742 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Lig3P97386 1015 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Npas2P97460 816 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PrlrQ08501 608 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Aars2Q14CH7 980 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mcm9Q2KHI9 1134 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mylk3Q3UIZ8 795 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 KrtdapQ3V2T4 102 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm14685Q52KH6 695 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ltbp3Q61810 1268 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mkl1Q8K4J6 964 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 LrgukQ9D5S7 820 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Eef1akmt2Q9D853 244 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ccdc86Q9JJ89 426 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Scube2Q9JJS0 997 aa12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm16430A6X8J1 155 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zscan5bB2RTN3 468 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Siah3B2RWG3 268 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pold2O35654 469 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Adam15O88839 864 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Chrm1P12657 460 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 SrgnP13609 152 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gnat1P20612 350 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 GsrP47791 500 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Phactr4Q501J7 694 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Arhgap44Q5SSM3 814 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kpna1Q60960 538 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cd6Q61003 665 aa12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PrkciQ62074 595 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Znf821Q6PD05 413 aa12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.4 ms