RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mccc1Q99MR8 717 aa9.52□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ilf2Q9CXY6 390 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arl2Q9D0J4 184 aa9.52□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trhr2Q9ERT2 382 aa9.52□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Timp4Q9JHB3 224 aa9.52□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stk11Q9WTK7 436 aa9.52□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klhdc7bA0A286YD60 1263 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rhox3fA2ANE1 215 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Itga9B8JK39 1036 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpina3iD3Z450 408 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Speer4f2E9Q366 295 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rap1gds1E9Q912 607 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ifi206G3UZV2 921 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm3424L7N298 263 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm8246M0QWX9 263 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kifc3O35231 824 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sept7O55131 436 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ctnnal1O88327 731 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LgmnO89017 435 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01631 113 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd2P08920 344 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc2a4P14142 509 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Brcc3P46737 291 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dynlt1P51807 113 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 YwhagP61982 247 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nrp1P97333 923 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Aars2Q14CH7 980 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pih1d3Q3KNI6 218 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfyve27Q3TXX3 415 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 E330034G19RikQ3UWX6 351 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ubn1Q4G0F8 1135 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Afap1l2Q5DTU0 825 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Shroom1Q5SX79 823 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ksr1Q61097 873 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bcar1Q61140 874 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PtprcapQ64697 197 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TwistnbQ78WZ7 330 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abcg2Q7TMS5 657 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Glra2Q7TNC8 452 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr412Q7TRW7 312 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zmym6Q8BS54 1249 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rccd1Q8BTU7 377 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc68Q8BVC4 333 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Neu4Q8BZL1 478 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sh3rf3Q8C120 878 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam151aQ8QZW3 608 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ItpkaQ8R071 459 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Brd8Q8R3B7 951 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnajc28Q8VCE1 385 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nle1Q8VEJ4 485 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Barhl2Q8VIB5 384 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Necab2Q91ZP9 389 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrps2Q924T2 291 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cpt1bQ924X2 772 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cybrd1Q925G2 290 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fuca1Q99LJ1 452 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrps17Q9CQE3 120 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trap1Q9CQN1 706 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TarsQ9D0R2 722 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DtnaQ9D2N4 746 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pus10Q9D3U0 527 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc103Q9D9P2 237 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rab13Q9DD03 202 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wfdc1Q9ESH5 211 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adrm1Q9JKV1 407 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nme7Q9QXL8 395 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdr54Q9R0D8 334 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Map3k6Q9WTR2 1291 aa9.51□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Igkv5-45A0A0B4J1J1 115 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Akap17bA2A3V1 959 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zscan5bB2RTN3 468 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdr95D3Z7A8 784 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrrc10bG3XA50 292 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm42641I6L9G2 585 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Capn6O35646 641 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P04214 136 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Enpp1P06802 906 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfy1P10925 782 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Icam1P13597 537 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scg3P47867 471 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mc4rP56450 332 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ripk2P58801 539 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hrh2P97292 397 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Col9a1Q05722 921 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nsun2Q1HFZ0 757 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdss1Q33DR2 409 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sppl2bQ3TD49 578 aa9.5□□□□□ -0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.8 ms