RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000056749.13

Nhlrc3-201, Transcript of NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nhlrc3, Length 5,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Znf473Q8BI67 892 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Catsper4Q8BVN3 442 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tldc1Q8K0P3 455 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Mapk8Q91Y86 384 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Kat2bQ9JHD1 813 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Skp1Q9WTX5 163 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Skint7A7XV04 395 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gm382B1AXN3 1250 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Zfp882E9Q4R4 555 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gm8909G3UXE9 396 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Calhm3J3QMI4 347 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prdx5P99029 210 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dpysl3Q62188 570 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Syt15Q8C6N3 418 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 RybpQ8CCI5 228 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Wnt8bQ9WUD6 350 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gucy2dA0A0U1RPR8 1117 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 FanceB8JJD6 213 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 G2e3Q5RJY2 716 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Q5XFZ0 217 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Abcg2Q7TMS5 657 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Il33Q8BVZ5 266 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Clec4a3Q8JZX6 237 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 DolkQ8R2Y3 534 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Zmynd10Q99ML0 440 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Fam32aQ9CR80 112 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Rnf135Q9CWS1 417 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Slc25a19Q9DAM5 318 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 CpqQ9WVJ3 470 aa11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gm29554A0A087WNW4 188 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Erich1E9PY43 332 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 ItgalP24063 1163 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tubgcp3P58854 905 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Arl5cQ6P068 179 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Rmdn2Q8BSE0 410 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Mrps33Q9D2R8 106 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Psmd12Q9D8W5 456 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 GabrqQ9JLF1 638 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Lama4P97927 1816 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ap1g2O88512 791 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PnpP23492 289 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 AdssP46664 456 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 VegfaQ00731 214 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tex11Q14AT2 947 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Mrgprx2Q3UG50 352 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Grik5Q61626 979 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Mtmr12Q80TA6 747 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tmtc3Q8BRH0 920 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Kctd15Q8K0E1 283 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ssh3Q8K330 649 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Epm2aip1Q8VEH5 606 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Synpo2Q91YE8 1087 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tssk3Q9D2E1 268 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 TtpalQ9D3D0 343 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gstt4Q9D4P7 240 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Vmn2r67K7N6T2 851 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 ThbdP15306 577 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Morf4l1P60762 362 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 MylpfP97457 169 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Oas1fQ14AZ4 364 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Scn2bQ56A07 215 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Arhgef38Q80VK6 770 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Lrrc1Q80VQ1 524 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dlk2Q8K1E3 382 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 ClyblQ8R4N0 338 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Olfr385Q8VGT1 312 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Nsmce3Q9CPR8 279 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Trap1Q9CQN1 706 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 ArskQ9D2L1 553 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Clca1Q9D7Z6 913 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 LrmdaQ9D9B4 229 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pdzd8B9EJ80 1147 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ddx43D3Z6P9 646 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gm20721E9Q2U8 318 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Vmn2r15L7N2A0 855 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Per1O35973 1291 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pde9aO70628 534 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Hsd17b1P51656 344 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dok6Q2MHE5 331 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Zfyve27Q3TXX3 415 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Fam131bQ3TY60 332 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 MelkQ61846 643 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gpsm1Q6IR34 673 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Npas4Q8BGD7 802 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Clec1aQ8BWY2 269 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pramel1Q99MW3 458 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 B4galt4Q9JJ04 344 aa11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 ThegQ9JMB1 375 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 64.5 ms