RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RbfaQ6P3B9 350 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf365Q8BG89 408 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CcnyQ8BGU5 341 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scara3Q8C850 606 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slfn5Q8CBA2 884 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrc66Q8K0B3 872 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hip1Q8VD75 1029 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1494Q8VGP8 315 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdhb3Q91XZ7 784 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dtwd1Q9D8U7 304 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Subh2bvQ9D9Z7 123 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tspan3Q9QY33 253 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Syt5Q9R0N5 386 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3002E9PW72 216 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm8369E9PZI3 166 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Syngr1O55100 234 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ca8P28651 291 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gbp1Q01514 589 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DselQ0VBN2 1207 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Grm5Q3UVX5 1203 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Garnl3Q3V0G7 1038 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Grm6Q5NCH9 871 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mxd4Q60948 209 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mef2dQ63943 514 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DazlQ64368 298 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc50Q810U5 305 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DrgxQ8BYH0 263 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam78aQ8C552 283 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Akirin1Q99LF1 191 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Noxred1Q9D3S5 366 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q9D4A5 307 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atg2aQ6P4T0 1914 aa10.5□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Serpine3E9Q6A2 401 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3739L7N296 216 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hcn2O88703 863 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnmt3cP0DOY1 709 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gnrh1P13562 90 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Anxa5P48036 319 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 B3gat3P58158 335 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ranbp9P69566 653 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gabpb1Q00420 383 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cntn3Q07409 1028 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr8Q60892 310 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpr65Q61038 337 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fastkd5Q7TMV3 762 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Traf3ip2Q8N7N6 555 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mgat5Q8R4G6 740 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pgam1Q9DBJ1 254 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chrac1Q9JKP8 129 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spint1Q9R097 507 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Apol8A2VDH7 339 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2310061I04RikB8JJ69 315 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 9330159F19RikD3Z623 648 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BC024978J3QPC3 361 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnk2O54967 1055 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hsd17b7O88736 334 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scg3P47867 471 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klhdc10Q6PAR0 439 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fra10ac1Q8BP78 315 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hdac7Q8C2B3 938 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pacs1Q8K212 961 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sike1Q9CPR7 207 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxo17Q9QZM8 286 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TfebQ9R210 475 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hao1Q9WU19 370 aa10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1023A2ASU6 311 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ifi206G3UZV2 921 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Casp8O89110 480 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01670 111 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01671 111 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01672 111 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ap2a1P17426 977 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gsta4P24472 222 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PrkcdP28867 674 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tubgcp3P58854 905 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PrkczQ02956 592 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Otol1Q4ZJM7 482 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Elf1Q60775 612 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MyorgQ69ZQ1 716 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf821Q6PD05 413 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wasf2Q8BH43 497 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Angel1Q8VCU0 667 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pofut2Q8VHI3 429 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atad3Q925I1 591 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Clstn3Q99JH7 956 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klhdc8bQ9D2D9 354 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ropn1Q9ESG2 212 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scamp5Q9JKD3 235 aa10.48□□□□□ -0.73
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Grik3B1AS29 919 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.7 ms