RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637910.1

ARID1B-233, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 2

Gene ARID1B, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-233	ENST00000637910	WSCD1	Q658N2	575 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	PMS2CL	Q68D20	193 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	TXNDC8	Q6A555	127 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	VSTM1	Q6UX27	236 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	KCNK18	Q7Z418	384 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	GPBP1	Q86WP2	473 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	CREG2	Q8IUH2	290 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	CEP76	Q8TAP6	659 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	TCTN2	Q96GX1	697 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	REEP2	Q9BRK0	252 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	EPN3	Q9H201	632 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	HPS4	Q9NQG7	708 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	NOTCH4	Q99466	2003 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	VWA8	A3KMH1	1905 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	C4orf47	A7E2U8	309 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	SOAT2	O75908	522 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	GSN	P06396	782 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	GAP43	P17677	238 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ANXA13	P27216	316 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	CD96	P40200	585 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	RBP5	P82980	135 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	SERINC3	Q13530	473 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	E2F5	Q15329	346 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	SURF1	Q15526	300 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ZNF77	Q15935	545 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	EOGT	Q5NDL2	527 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	RASSF3	Q86WH2	238 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	SYT12	Q8IV01	421 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	OTUB2	Q96DC9	234 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	SPATA17	Q96L03	361 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	LNP1	A1A4G5	178 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	WASH4P	A8MWX3	477 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	AP5Z1	O43299	807 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	DTNB	O60941	627 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ESR1	P03372	595 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	APOD	P05090	189 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	FAM163B	P0C2L3	166 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ARSA	P15289	507 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	HDC	P19113	662 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	DDIT3	P35638	169 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ACOT2	P49753	483 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	GUCY2F	P51841	1108 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	EGR3	Q06889	387 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	CCDC6	Q16204	474 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	CRY1	Q16526	586 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	IL17A	Q16552	155 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	BRAP	Q7Z569	592 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	STKLD1	Q8NE28	680 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	USP33	Q8TEY7	942 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	RAD54L	Q92698	747 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	ACCS	Q96QU6	501 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-233	ENST00000637910	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms