RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629846.2

PFKM-232, Transcript of phosphofructokinase, muscle, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PFKM, Length 381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKM-232ENST00000629846 RRAGCQ9HB90 399 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 KRT82Q9NSB4 513 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 THAP1Q9NVV9 213 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 DDIT4Q9NX09 232 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 COX16Q9P0S2 106 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 ZFATQ9P243 1243 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 HEY2Q9UBP5 337 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 GGT7Q9UJ14 662 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 CHKBQ9Y259 395 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 NME7Q9Y5B8 376 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 USP3Q9Y6I4 520 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 SQORQ9Y6N5 450 aa7.36□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 SCN1AP35498 2009 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 A0A0G2JND7 137 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 WDR27A2RRH5 827 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 CLDN5O00501 218 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 PTGESO14684 152 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 ADCY6O43306 1168 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 TIMM44O43615 452 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 RFPL1O75677 317 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 CABYRO75952 493 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 NEBLO76041 1014 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 CYP11A1P05108 521 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 APOA4P06727 396 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 BPGMP07738 259 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 ERCC2P18074 760 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 DNAJB1P25685 340 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 GP5P40197 560 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 POLD2P49005 469 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 CXCR3P49682 368 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 PRKAA2P54646 552 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 NKX3-2P78367 333 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 ASPHQ12797 758 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 MTA1Q13330 715 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 DPYSQ14117 519 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 ZNF618Q5T7W0 954 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 MROH9Q5TGP6 573 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 RGMBQ6NW40 437 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 SERINC5Q86VE9 423 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 LCA5Q86VQ0 697 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 IFNL1Q8IU54 200 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 ARHGAP18Q8N392 663 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 STKLD1Q8NE28 680 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 HDAC11Q96DB2 347 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 HAPLN3Q96S86 360 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 GAD1Q99259 594 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 LGMNQ99538 433 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 CXCL16Q9H2A7 254 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 ABCC13Q9NSE7 274 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 FLRT1Q9NZU1 646 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 FNIP2Q9P278 1114 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 HAO1Q9UJM8 370 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 GJD2Q9UKL4 321 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 TRIP11Q15643 1979 aa7.35□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.34□□□□□ -1.23
PFKM-232ENST00000629846 ARL5CA6NH57 179 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms