RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612161.4

SLC38A1-211, Transcript of solute carrier family 38 member 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC38A1, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A1-211ENST00000612161 SPATA17Q96L03 361 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TWNKQ96RR1 684 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 UCK1Q9HA47 277 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TDP1Q9NUW8 608 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 DDX19BQ9UMR2 479 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TNRQ92752 1358 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 BTBD19C9JJ37 291 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 GOLGA8RI6L899 631 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ACOT7O00154 380 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PIK3R2O00459 728 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SUPT3HO75486 399 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 KRT6AP02538 564 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TK1P04183 234 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 KRT6BP04259 564 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CSF1P09603 554 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 AXLP30530 894 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PLCD1P51178 756 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 EVCP57679 992 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.373e-7■■■■□ 23.3
SLC38A1-211ENST00000612161 SNAPC2Q13487 334 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 BNIPLQ7Z465 357 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 MICU3Q86XE3 530 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 HACE1Q8IYU2 909 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CAGE1Q8TC20 777 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CNDP1Q96KN2 507 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CIB1Q99828 191 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 DESI2Q9BSY9 194 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 VCXQ9H320 206 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 MTG2Q9H4K7 406 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 INIPQ9NRY2 104 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 BTBD7Q9P203 1132 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.5□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 DEPDC5O75140 1603 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 F8W810 466 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 H3BQV1 296 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 OPHN1O60890 802 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SCGB1D1O95968 90 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 NPPAP01160 153 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 FUCA1P04066 466 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 APOA4P06727 396 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 GSTT2P0CG29 244 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 GSTT2BP0CG30 244 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CALM1P0DP23 149 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CALM2P0DP24 149 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CALM3P0DP25 149 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 IL1R1P14778 569 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SYN1P17600 705 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 MALP21145 153 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CD86P42081 329 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TXKP42681 527 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PRKAA2P54646 552 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ACTR2P61160 394 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 MXRA7P84157 204 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TLE1Q04724 770 aa6.49□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ZBTB16Q05516 673 aa6.49□□□□□ -1.37
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