RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNC1P48547 511 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NPEPPSP55786 919 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RESTQ13127 1097 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS6KA2Q15349 733 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 BAK1Q16611 211 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 BMT2Q1RMZ1 405 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CACHD1Q5VU97 1274 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SYT13Q7L8C5 426 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FITM2Q8N6M3 262 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FNIP1Q8TF40 1166 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GRAMD1AQ96CP6 724 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR20Q99678 358 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TTYH3Q9C0H2 523 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC68Q9H2F9 335 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 L2HGDHQ9H9P8 463 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT84Q9NSB2 600 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ETAA1Q9NY74 926 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP45Q9UL16 551 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NAV1Q8NEY1 1877 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 COL4A1P02462 1669 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2QL1A1L167 161 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 EFCAB8A8MWE9 144 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 B5MCH6 92 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 STX16O14662 325 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CPLX1O14810 134 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS6KA4O75676 772 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CDKL5O76039 1030 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 STC2O76061 302 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 URI1O94763 535 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS23O95084 383 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RASAL1O95294 804 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 AKR1B1P15121 316 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TGM1P22735 817 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CHMP24386 653 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MSNP26038 577 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCD3P28288 659 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SERPINA4P29622 427 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CCR9P51686 369 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 EVCP57679 992 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HAND2P61296 217 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GALNT2Q10471 571 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GPS1Q13098 491 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FHL3Q13643 280 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ALX1Q15699 326 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PTCHD3Q3KNS1 767 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HS1BP3Q53T59 392 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ATL3Q6DD88 541 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR23BQ6ZRT6 265 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MED25Q71SY5 747 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 XYLT1Q86Y38 959 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 USP38Q8NB14 1042 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 BICD2Q8TD16 824 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR60Q8WVS4 1066 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CPT1BQ92523 772 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NELL1Q92832 810 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP2R3CQ969Q6 453 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TIGD1Q96MW7 591 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SPATA25Q9BR10 227 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 AP1M1Q9BXS5 423 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NACAP1Q9BZK3 213 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NAPBQ9H115 298 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 IL23AQ9NPF7 189 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFAF4Q9P032 175 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D29Q9UFV1 150 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NARFQ9UHQ1 456 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 BRWD3Q6RI45 1802 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC37AA6NMS7 1700 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0G2JLW4 131 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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