RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIPC1-205	ENST00000586027	TRIM24	O15164	1050 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	PJA2	O43164	708 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	CACNG3	O60359	315 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	CYBB	P04839	570 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	IL1R2	P27930	398 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	PCK1	P35558	622 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	MESD	Q14696	234 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	PON2	Q15165	354 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	KIAA1328	Q86T90	577 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	FAM3C	Q92520	227 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	MSANTD3	Q96H12	275 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	C1orf74	Q96LT6	269 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GIPC1-205	ENST00000586027		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	FAM72C	H0Y354	149 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	TBL1X	O60907	577 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	GALK1	P51570	392 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	RNF43	Q68DV7	783 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	FAM72B	Q86X60	149 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	FOXQ1	Q9C009	403 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	STIM2	Q9P246	746 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	TULP3	O75386	442 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	SHD	Q96IW2	340 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	USP18	Q9UMW8	372 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	MAN2B1	O00754	1011 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	CA9	Q16790	459 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	C5orf22	Q49AR2	442 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	CD101	Q93033	1021 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	FBXO10	Q9UK96	956 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027		E9PAM4	449 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	PRPSAP2	O60256	369 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	AMPD2	Q01433	879 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	KDSR	Q06136	332 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	MPP7	Q5T2T1	576 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	BUB1	O43683	1085 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	CISD3	P0C7P0	127 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	MAN1A1	P33908	653 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	ARHGAP25	P42331	645 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	AIF1	P55008	147 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	TAS2R40	P59535	323 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	EFHC2	Q5JST6	749 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	NEU3	Q9UQ49	428 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	SRGAP2	O75044	1071 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	CNTN5	O94779	1100 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	ZWILCH	Q9H900	591 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GIPC1-205	ENST00000586027	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		32.4	■■■□□ 2.78

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