RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNQ3	O43525	872 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HMMR	O75330	724 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS4B	O75351	444 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PTP4A3	O75365	173 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	JTB	O76095	146 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TK1	P04183	234 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGA2B	P08514	1039 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GYS1	P13807	737 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NPR1	P16066	1061 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	POLD2	P49005	469 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX16	P57768	344 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTR2	P61160	394 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	BECN1	Q14457	450 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TBCC	Q15814	346 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	BAK1	Q16611	211 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP85	Q6P2H3	762 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf88	Q6PI97	169 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX11	Q8IYF3	940 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNT16	Q8N428	558 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	USP38	Q8NB14	1042 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ST8SIA4	Q92187	359 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	C18orf8	Q96DM3	657 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FEM1C	Q96JP0	617 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX22	Q96L94	193 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PNPO	Q9NVS9	261 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FEM1B	Q9UK73	627 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RAD54B	Q9Y620	910 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957		H0YIZ8	118 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJB5	O75953	348 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN9	O75954	239 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	STARD3NL	O95772	234 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GLP2R	O95838	553 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	AHSG	P02765	367 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MT-ND5	P03915	603 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	APOA4	P06727	396 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CSF1	P09603	554 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ACADM	P11310	421 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SCP2	P22307	547 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GABRB3	P28472	473 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CD6	P30203	668 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MCM2	P49736	904 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	COPA	P53621	1224 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	BPIFB3	P59826	476 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MAVS	Q7Z434	540 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	USP37	Q86T82	979 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	DTX2	Q86UW9	622 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	LCA5	Q86VQ0	697 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	HSCB	Q8IWL3	235 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL10	Q8N8L6	244 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		3.08	□□□□□ -1.92

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